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文檔簡介
1、干擾素(Interferon, IFN)是一類具有廣譜抗病毒、抗腫瘤和增強(qiáng)免疫功能的細(xì)胞因子,其抗病毒作用是通過誘導(dǎo)一系列干擾素刺激基因(Interferon-stimulated genes,ISGs)表達(dá)產(chǎn)生抗病毒蛋白而實(shí)現(xiàn)的。ISG20基因是新近發(fā)現(xiàn)的一種表達(dá)20kDa蛋白的干擾素刺激基因,表達(dá)產(chǎn)物具有核酸外切酶活性,能降解單鏈RNA及DNA,研究證實(shí)在同時(shí)敲除PKR、2',5'-OAS及Mx三個(gè)基因的小鼠成纖維母細(xì)胞中表達(dá)ISG
2、20能抑制水皰性口炎病毒(VSV)的增殖,說明ISG20參與介導(dǎo)IFN的抗病毒作用。
豬繁殖與呼吸綜合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)是一種單股正鏈RNA病毒,引起豬的繁殖與呼吸綜合征(porcine reproductive and respiratory syndrome, PRRS),給世界養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。尋找有效
3、的抗病毒基因?qū)榭筆RRSV品系的培育和PRRS的有效預(yù)防控制創(chuàng)造條件,為此本研究以豬干擾素刺激基因ISG20為研究對(duì)象,對(duì)其在PRRSV增殖中的作用進(jìn)行了初步探討。主要研究內(nèi)容如下:
1.豬ISG20的克隆、序列分析及其進(jìn)化樹的繪制
以PK-15細(xì)胞的cDNA為模板,RT-RCR擴(kuò)增獲得豬ISG20的編碼區(qū)序列,序列分析發(fā)現(xiàn)該基因全長為516bp,可編碼171個(gè)氨基酸殘基,與GenBank上所報(bào)道的豬ISG
4、20氨基酸序列同源性為99%,與牛、狗、人、類人猿、猴、馬、小鼠、大鼠的氨基酸序列同源性分別為:91%、84%、80%、80%、78%、76%、73%、72%。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明:不同物種ISG20之間的氨基酸序列同源性很高,說明ISG20在進(jìn)化中是高度保守的。
2.豬ISG20結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與功能分析
通過蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)豬ISG20在6~171位氨基酸之間有3個(gè)Asp(D)殘基、1個(gè)Glu(E)殘基和一個(gè)核
5、酸外切酶功能域,說明豬ISG20屬于DEDD核酸外切酶超家族。此外,在豬ISG20蛋白中,含45.03%的α-螺旋,24.56%的β-折疊和30.43%的無規(guī)則卷曲,這一比例符合α/β折疊蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)比例。以人ISG20的三級(jí)結(jié)構(gòu)為模板,同源建模豬ISG20相應(yīng)區(qū)段的三級(jí)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)豬ISG20與人ISG20的相應(yīng)結(jié)構(gòu)域非常相似,這提示它的生物學(xué)功能可能與人ISG20相似。
3.豬ISG20的真核表達(dá)及其亞細(xì)胞定位分析
6、r> 構(gòu)建了野生型豬及核酸外切酶活性功能缺失突變型ISG20的真核表達(dá)質(zhì)粒,Westernblot分析證實(shí)兩種質(zhì)粒均能有效表達(dá)ISG20。將野生型豬ISG20基因插入pEGFP-C1下游獲得ISG20與EGFP融合的真核表達(dá)質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染細(xì)胞后,經(jīng)激光共聚焦顯微鏡檢測(cè),發(fā)現(xiàn)豬ISG20主要位于細(xì)胞核,在細(xì)胞漿內(nèi)只有少量的分布。
4.豬ISG20對(duì)PRRSV增殖的影響
運(yùn)用絕對(duì)定量及TCID50分析,發(fā)現(xiàn)表達(dá)
7、的野生型豬ISG20對(duì)PRRSV的增殖有顯著的抑制作用,而表達(dá)無核酸外切酶活性的突變型豬ISG20對(duì)PRRSV的增殖無影響,說明豬ISG20對(duì)PRRSV的抑制作用依賴其核酸外切酶活性。
5.PRRSV感染對(duì)豬ISG20基因表達(dá)的影響
以PRRSV感染SJPL細(xì)胞,相對(duì)定量RT-PCR分析PRRSV感染對(duì)豬ISG20基因表達(dá)的影響,發(fā)現(xiàn)PRRSV感染SJPL細(xì)胞能顯著誘導(dǎo)豬ISG20基因的表達(dá),因此,我們推測(cè)宿
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