中國對蝦肝胰腺細(xì)小病毒(HPV-Pc)全基因組分析及其衣殼蛋白的表達.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、對蝦肝胰腺細(xì)小病毒(Hepatopancreaticparvovirus,HPV)是世界各地養(yǎng)殖和野生對蝦的重要病原之一,隸屬于細(xì)小病毒科(Parvovirus),細(xì)小病毒亞科(Parvoviridae)。它分布廣泛,雖然對對蝦的致死率不是很高,但能使中國明對蝦(Fenneropenaeuschinensis)、.斑節(jié)對蝦(Penaeusmonodon)等10多種對蝦生長畸形,導(dǎo)致慢性矮小殘缺綜合癥(runt-deformitysynd

2、rome,RDS),造成較大的經(jīng)濟損失。目前,GenBank已經(jīng)收錄了分離自泰國、印度、澳大利亞、韓國、馬達加斯加等地的HPV全長或部分基因組序列。雖然中國大陸局部地區(qū)在養(yǎng)殖對蝦中檢測到了HPV,但未見其基因組序列的報道。且目前國內(nèi)外均沒有相關(guān)HPV功能基因的相關(guān)研究。本文首次克隆了中國地區(qū)對蝦HPV全基因組序列,并對其結(jié)構(gòu)蛋白進行了表達、自組裝病毒樣顆粒(VLPS)機制的研究,進而可以利用RNAi、抗體阻斷、競爭抑制物、小分子藥效團的

3、開發(fā)等基因工程、轉(zhuǎn)錄工程、蛋白質(zhì)工程以及新近的代謝工程技術(shù)來實現(xiàn)防治WSSV的感染。
   本研究主要包括3部分內(nèi)容:
   中國對蝦肝胰腺細(xì)小病毒HPV-Pc(河北分離株)全基因組序列的克隆及序列分析本論文首先利用RACE技術(shù),根據(jù)已知的一段序列設(shè)計兩對正向、反向引物,通過DNA末端加尾和嵌套PCR克隆了HPV基因3’片段和5’片段序列,然后將3部分片段拼接后得到中國河北株HPV基因組序列。不同地區(qū)、不同對蝦HPV基因

4、組有較大差異,河北株HPV基因組長6085nt,與其它已知序列同源性在78%~91%之間,差異遍布整個序列中。HPV基因組由兩末端非編碼序列和三個開放閱讀框(openreadingframe,ORF)構(gòu)成。三個ORF分別包括1384nt、1737nt和2466nt,預(yù)測分別編碼非結(jié)構(gòu)蛋白2(nonstructuralprotein2,NS2)、非結(jié)構(gòu)蛋白1(nonstructuralprotein1,NS1)和衣殼蛋白(capsidpr

5、otein,CP),分子量分別為50kDa,66kDa和92kDa。2衣殼蛋白CP的原核重組質(zhì)粒pET30a-CP的構(gòu)建及其在E.coli中表達分析本實驗基于河北株HPV的CP基因設(shè)計了一對引物,并引入BamHI和XhoI酶切位點,PCR擴增出cp的基因片段,將全長衣殼蛋白基因分別定向克隆到原核表達載體pET30a(+),轉(zhuǎn)化進入大腸桿菌EscherichiacoliBL21中,經(jīng)雙酶切、菌落PCR、測序鑒定,表明成功構(gòu)建了原核重組表達

6、載體pET30a(+)-CP。陽性單克隆經(jīng)IPTG濃度梯度、溫度梯度誘導(dǎo)優(yōu)化表達條件,成功表達了氨基末端融合有6個組氨酸標(biāo)簽的衣殼蛋白,SDS-PAGE和WesternBlot分析在菌體裂解沉淀中可見97kDa左右的特異性條帶,而不同溫度誘導(dǎo)上清中均沒有特異性條帶出現(xiàn),表明原核表達HPV重組衣殼蛋白(recombinantHPVcapsidprotein,rCP)以包涵體的形式表達,所以在變形條件下用金屬螯合親和層析柱對rCP進行純化、

7、透析復(fù)性去除變性劑。電鏡觀察復(fù)性蛋白結(jié)果rCP可形成直徑約為22nm的完整或不完整病毒樣顆粒(virus-likeparticles,VLPs),其外觀與已報道過的天然HPV病毒顆粒相似;通過SDS-PAGE后切膠大量制備重組蛋白rCP,經(jīng)Western-blot鑒定后作為抗原直接免疫小白鼠來制備抗CP的多克隆抗體。制備的抗血清經(jīng)Western-blot和ELISA法檢測抗體的特異性和效價。結(jié)果表明抗CP多克隆抗體能特異性識別rCP,效

8、價測定結(jié)果為1∶600。多抗的制備對于后續(xù)的CP活性蛋白的測定以及病毒樣顆粒的定性研究都有很重要的價值。
   3rCP的真核重組質(zhì)粒pEGFP-CP的構(gòu)建及轉(zhuǎn)染人胚腎293T細(xì)胞、大菱鲆鰭條細(xì)胞的研究衣殼蛋白CP基因分別引入BamHI和Xhol酶切位點,將PCR擴增的目的片段定向克隆到真核表達載體pEGFP-N1,經(jīng)酶切、菌落PCR鑒定后測序,表明成功構(gòu)建了真核表達質(zhì)粒EGFP-N1-CP。提取濃度大于2.5mg/ml的重組質(zhì)

9、粒后,分別轉(zhuǎn)染人胚腎293T細(xì)胞和大鯪鲆鰭條細(xì)胞,熒光顯微鏡能夠檢測到熒光產(chǎn)生,電鏡結(jié)果顯示,可溶性的rCP可形成數(shù)量不多的直徑約為22nm的病毒樣顆粒(virus-likeparticles,VLPs),說明rCP以可溶的形式得到表達??梢钥闯觯琀PVVLPs的形成不需要HPV的其他蛋白及其DNA或RNA的參與,并且融合表達的His和GFP標(biāo)簽展示于VLPs的表面且不影響VLPs的形成g鑒于HPV與對蝦白斑綜合癥病毒(Whitespo

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