半滑舌鰨等九種海水魚微衛(wèi)星分子標記的開發(fā)和應用.pdf

1、渤海是黃海乃至整個北方海洋漁業(yè)資源的源頭。面積約7.8萬平方公里的渤海,是黃海、渤海乃至東海多種經(jīng)濟魚蝦類的主要產(chǎn)卵場、育幼場和索餌場,黃、渤海有魚類300余種。歷史上,渤海最高年捕撈量約占全國捕撈總量的十分之一。渤海漁業(yè)對全國海洋漁業(yè)的發(fā)展意義重大。但是,自上世紀80年代以來,由于長期的酷漁濫捕和水域污染、涉海工程建設(shè)等人為因素的共同影響,渤海漁業(yè)資源嚴重衰退,生態(tài)結(jié)構(gòu)遭到嚴重破壞,生物多樣性明顯下降,種類組成趨于小型化、低質(zhì)化,資源

2、生產(chǎn)功能嚴重退化。為了更好地保護和合理利用渤黃海漁業(yè)資源,采用不同分子標記對一些具有重要經(jīng)濟價值或生態(tài)學意義的魚類進行群體遺傳分析,是魚類生態(tài)學、水產(chǎn)資源學以及魚類遺傳與育種學不可缺少的應用基礎(chǔ)性的研究工作。
　　 本研究主要包括三部分內(nèi)容:第一部分是基于磁珠富集的方法,構(gòu)建了半滑舌鰨、牙鲆、綠鰭馬面純、藍點馬鮫、小黃魚、(鱖)魚、黑鯛7種海水魚部分基因組DNA微衛(wèi)星富集文庫。通過篩選測序分別獲得131、202、121、33、2

3、3、60、35條含有微衛(wèi)星的序列,其中完美型、非完美型、混合型所占的平均比例分別為76.80％、13.66％和9.54％。文章中優(yōu)化的FIASCO法由于自身的高效低耗等優(yōu)點成為從海水魚類中大量篩選微衛(wèi)星標記的最好選擇。
　　 第二部分是根據(jù)構(gòu)建的富集文庫中以及GENBANK數(shù)據(jù)庫中的微衛(wèi)星序列設(shè)計微衛(wèi)星引物,對綠鰭馬面(純)、皮氏叫姑魚、梭魚3種魚類的自然捕撈群體進行了遺傳結(jié)構(gòu)的分析,利用至少21個體對其中162個位點進行多態(tài)性

4、評價,結(jié)果顯示擴增得到的等位基因數(shù)目從2到18個不等,期望雜合度(He)和觀測雜合度(Ho)的范圍分別為0.1463到0.9449和0.1562到1.0000,平均值分別為0.6437和0.5774。其中皮氏叫姑魚微衛(wèi)星位點的平均期望雜合度最高為0.8052,說明其有較高的雜合性。
　　 第三部分內(nèi)容是半滑舌鰨微衛(wèi)星標記在遺傳圖譜構(gòu)建、雌雄群體與人工誘導雌核發(fā)育后代基因型分析中的應用:1.為初步構(gòu)建半滑舌鰨遺傳圖譜,以全同胞家系

5、產(chǎn)生的84個F1子代為作圖群體,對306對SSR引物進行多態(tài)篩,共獲得在雙親與后代中分離的多態(tài)微衛(wèi)星標記表記100個,可用于遺傳連鎖分析。但若需進行主基因和QTL的分析以及真正實現(xiàn)分子標記輔助選擇育種,還需獲得更多多態(tài)分離標記以及開發(fā)新型SNP標記,以提高圖譜中標記的覆蓋水平;2.用8對半滑舌鰨微衛(wèi)星標記對來自同一母本半滑舌鰨減數(shù)雌核發(fā)育魚苗24尾進行了分析。其中4個座位全部為雜合。雜合比例最低的座位是Newcyse105,為0.583