富集文庫法開發(fā)谷子的微衛(wèi)星分子標(biāo)記.pdf

1、河北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文富集文庫法開發(fā)谷子的微衛(wèi)星分子標(biāo)記姓名：李琳申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：微生物學(xué)指導(dǎo)教師：刁現(xiàn)民趙寶華20080520個谷子和8個青狗尾草品種檢測它們的多態(tài)性信息，結(jié)果在篩選出的22對(564％)多態(tài)性引物中共檢測到185個等位基因，每對引物平均為841個；其中引物GTDZ773和AGDZ2341檢測到的等位基因最多(16個)，最少的AGDZ2310中檢測到2個，其PIC值分別為09l、0。90和O37，22對引物平

2、均PIC值為O76，顯示出較高的位點(diǎn)變異頻率，說明所開發(fā)的SSR標(biāo)記適用于谷子和狗尾草屬遺傳學(xué)研究。利用多態(tài)性SSR引物在28份狗尾草屬不同種和品種間擴(kuò)增，統(tǒng)計(jì)各標(biāo)記的等位基因頻率分布，22個多態(tài)性引物總共檢測到221個等位基因，不同品種間變異范圍為2～22個，平均1005個；平均PIC值為078，變異范圍在037～093之間。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，SSR標(biāo)記在谷子、青狗尾草及其它種狗尾草中的多樣性表現(xiàn)不同，三者中發(fā)現(xiàn)的等位基因數(shù)分別為138

3、、175和194個，分別占總數(shù)(221)的624％、792％和878％，而且青狗尾草品種平均PIC值(O73)高于谷子品種(072)，證明谷子間的遺傳差異低于野生青狗尾草；同時數(shù)據(jù)對比表明，青狗尾草與谷子間的親緣關(guān)系比其它種狗尾草近。根據(jù)這22個標(biāo)江卉谷子及近緣野生種的變異數(shù)據(jù)，計(jì)算各基因型的遺傳相似系數(shù)，根據(jù)SM系數(shù)進(jìn)行聚類分析，采用uPC、fA法構(gòu)建狗尾草屬遺傳進(jìn)化關(guān)系圖，結(jié)果表明：所用22個SSR標(biāo)記即可將28份材料清晰分為2大類

4、群(青狗尾草類群和金色狗尾草類群)，3個小組(谷子、青狗尾草、金色狗尾草)，而且谷子與青狗尾草之間的遺傳距離小于與其它種的遺傳距離，進(jìn)一步證實(shí)了谷子起源于青狗尾草的觀點(diǎn)；谷子相對緊密的聚在一起，且其間的遺傳差異明顯小于狗尾草，證明谷子在進(jìn)化中發(fā)生遺傳變異的幾率相對狗尾草較低，表明其基因組的相對保守性；而通過對2大類群間差異的分析得出，金色狗尾草類群可能早于谷子和狗尾草分化之前就已經(jīng)與它們分開，從一定程度上揭示了狗尾草屬基因組進(jìn)化情況。本