蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜分析的方法學研究.pdf

1、細胞內(nèi)蛋白質(zhì)豐度動態(tài)的變化對生命過程有重要影響。精確的對生物體蛋白質(zhì)進行定量研究，對于探索以及發(fā)現(xiàn)疾病標志物是非常重要的。定量蛋白質(zhì)組學研究的最終目的是對某體系不同狀態(tài)下的所有復雜蛋白進行鑒定和定量，這一方向是當前生物科學領(lǐng)域研究的重要內(nèi)容。
　　目前，研究定量蛋白質(zhì)組學的方法主要分兩類:一類是無標記定量方法，主要是通過比較質(zhì)譜峰的強度和質(zhì)譜分析的次數(shù)，從而實現(xiàn)分析不同來源的蛋白樣品的量的變化。在本課題中，我們利用Skyline結(jié)

2、合Diffprot軟件對Waters公司的Q-TOF儀器的MSE數(shù)據(jù)進行進一步的蛋白質(zhì)組定量分析。通過數(shù)據(jù)分析證明，與商用軟件和手動分析方法相比，Skyline軟件的計算結(jié)果更加可靠省時，這使得蛋白質(zhì)通過MSE方法進行無標定量的研究變的更加快速方便;另一類定量蛋白質(zhì)組學研究方法是基于標記技術(shù)的定量方法，是用針對某一類蛋白所具有的特異性化學探針標記目的肽段或蛋白，從而實現(xiàn)對表達蛋白質(zhì)差異性以及修飾蛋白的差異進行精確的定量和進一步的分析。在