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文檔簡介
1、南方醫(yī)科大學2012級博士學位論文遺傳性多囊腎病基因變異診斷體系的建立及應用Establishmentandapplicationofdiagnosticsystemforgenemutationanalysisofhereditarypolycystickidneydisease課題來源:廣東省醫(yī)學科研基金廣東省科技廳公益研究與能力建設專項資金國家自然科學基金學位申請人導師姓名專業(yè)名稱培養(yǎng)類型培養(yǎng)層次所在學院劉維強石玉玲教授l臨床檢驗
2、診斷學專業(yè)學位博士廣州軍區(qū)廣州總醫(yī)院答辯委員會主席吳英松研究員王文敬教授答辯委員會委員段朝暉主任技師徐邦牢主任技師夏勇主任技師2015年3月28日廣州摘要是一種非特異性陽離子通道;ARPKD則與6p12區(qū)域的PKHDl基因突變相關,其基因產(chǎn)物則是Fibrocystin/Polyductin(FPC)。對多囊腎病的致病基因研究發(fā)現(xiàn),ADPKD和ARPKD均以點突變致病為主,大片段缺失、重復或重排只占致病原因的極少數(shù)(3%4%)。因此,對多
3、囊腎病的基因診斷技術以序列測序為主。然而,相對其他遺傳性單基因疾病診斷,多囊腎基因的診斷要復雜的多,尤其是對ADPKD基因的診斷目前存在幾個方面的困難。首先,ADPKD具有明顯的基因異質(zhì)性,PKDl和PKD2兩個基因變異均可引起ADPKD,其中PKDl基因突變占全部病因的85%,臨床表型也較PKD2基因突變病人嚴重得多,病人透析或腎移植時間平均要比PKD2基因突變病人提前20年發(fā)生[7,8】。其次,現(xiàn)有的研究證明,ADPKD基因突變不存
4、在所謂的熱點,意味著PKDl或PKD2突變位點有著高度的不確定性,基因的整個蛋白編碼區(qū)域及轉(zhuǎn)錄剪切位點都可能發(fā)生突變而導致疾病的發(fā)生[9,10】。第三,PKDl基因133號外顯子存在6個序列高度相似的假基因,并且此基因空間結(jié)構復雜,部分區(qū)域GC含量高達70%甚至80%,這些都給PKDl基因測序和突變分析帶來了極大困難【11,12】。目前雖已有多種方法可對多囊腎基因進行變異診斷,但均存在技術上的缺陷和不足,難以廣泛應用。隨著新一代測序技術
5、(NGS)的日臻成熟,NGS在遺傳性疾病診斷中的應用越來越多【1315]。由于NGS技術可以同時對大量DNA片段進行并行處理,其測序效率比傳統(tǒng)的Sanger測序大幅提高,加大測序深度后還可檢測極低比例的嵌合變異。因此,NGS新技術的應用將能有效克服多囊腎基因診斷的技術瓶頸。由于ADPKD是一種非常典型的家族遺傳性疾病,該病具有遲發(fā)性的特點,很多患者在疾病確診時已經(jīng)結(jié)婚生子,遺傳給下一代的可能性高達50%,這給患者的家庭帶來極大的精神壓力
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