膀胱癌遺傳分?jǐn)?shù)的計(jì)算及發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型的構(gòu)建.pdf

1、背景：膀胱癌是泌尿系統(tǒng)常見腫瘤之一。在中國(guó)，隨著生活習(xí)慣的改變及診療水平的提高，膀胱癌的發(fā)病率逐年增長(zhǎng)。2012年全國(guó)腫瘤登記地區(qū)膀胱癌的發(fā)病率為6.61/10萬(wàn)，已經(jīng)成為主要的公共衛(wèi)生問(wèn)題。膀胱癌的發(fā)病不僅給患者帶來(lái)了嚴(yán)重的痛苦，而且給社會(huì)和家庭也帶來(lái)了一定的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。近年來(lái)，歐美國(guó)家在膀胱癌的遺傳易感性研究上取得了極大進(jìn)展，截止目前，通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome Wide Association Studies，GWAS)的方

2、法共發(fā)現(xiàn)13個(gè)與膀胱癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(Single nucleotide polymorphism，SNPs)。其中有3個(gè)SNP在中國(guó)人群中得到了驗(yàn)證。但是，這3個(gè)SNP位點(diǎn)在中國(guó)人群中的聯(lián)合作用還未可知。
　　方法：基于已發(fā)現(xiàn)并在中國(guó)人群中驗(yàn)證的3個(gè)與膀胱癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的SNP位點(diǎn)，在來(lái)自中國(guó)上海的1210名膀胱癌患者及1008名社區(qū)對(duì)照中選用TaqMan探針進(jìn)行基因分型實(shí)驗(yàn)，并通過(guò)計(jì)算研究對(duì)象基于這3個(gè)SNPs位

3、點(diǎn)的遺傳分?jǐn)?shù)(geneticscore)對(duì)這些遺傳變異的綜合預(yù)測(cè)膀胱癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)效應(yīng)進(jìn)行了分析。接下來(lái)聯(lián)合研究對(duì)象的吸煙狀況（有或無(wú)），身體質(zhì)量指數(shù)(Body Mass Index, BMI)，對(duì)男性人群經(jīng)過(guò)年齡的校正建立膀胱癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)模型，模型的區(qū)分能力和模型的準(zhǔn)確度使用受試者工作曲線(receiver operating characteristic curve，ROC)和Hosmer-Lemeshow goodness-of-

4、fit檢驗(yàn)并進(jìn)行評(píng)價(jià)。
　　結(jié)果：
　　1.在我們獨(dú)立的驗(yàn)證人群中，3個(gè)SNPs位點(diǎn)均與膀胱癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(P＜0.05)。
　　2.基于3個(gè)SNPs位點(diǎn)計(jì)算得到的遺傳分?jǐn)?shù)在病例組明顯高于對(duì)照組，其均值分別為1.05和0.99(P=1.03E-05)。經(jīng)過(guò)年齡，性別和吸煙狀態(tài)的校正，與遺傳分?jǐn)?shù)＜=1.00者相比，擁有較高genetic score值(＞1.00)會(huì)使其膀胱癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加（OR=1.58，95％ CI=1

5、.21-2.06，P=0.0007）。
　　3.低級(jí)別腫瘤(Ta)與膀胱癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.24，95％ CI=1.66-3.01，P=1.02E-07)較高級(jí)別腫瘤(Tis，T1-T4)更為明顯(OR=1.33，95％CI=1.00-1.78,P=0.05, P=0.001)。
　　4.基于所有男性樣本，建立的膀胱癌發(fā)病預(yù)測(cè)模型為E{Yi}=ln(πi/1-πi)=0.40 Xsmoking+0.45 Xgenetic