肺癌相關(guān)MAGE家族的生物信息學(xué)分析.pdf_第1頁
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1、fD』uuJ寸£:jLiD(’以、j|文蝙I:0313302039碩士學(xué)位論文肺癌相關(guān)MAGE家族的生物信息學(xué)分析。71f立、p清,,、寧師矬矗砭H:你:專業(yè)£_=l=’許健何淼副教授動物擘二00五年五H二十三口通過構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,發(fā)現(xiàn)IAGE—A、MAGEB與lAGEc亞家族在系統(tǒng)進(jìn)化樹上屬于同一分支,這個結(jié)果佐證了隋延仿等(2004)的觀點依據(jù)前人的研究基礎(chǔ),結(jié)合本文的生物信息學(xué)分析,對MAGE家族做出以下推測:MAGE—A、MAG

2、E—C、MAGE—E弧家族的所有成員,以及MAGE—B6、MAGE—Dl也可能主要在腫瘤組織和胎兒組織中表達(dá),而MAGE—B(除MAGE—B6步)、MAGE—D(除MAGE—D1,)、MAGE一11l、MAGE—G1、lAGE—F1、MAGEL2、NECDIN及RESDIN主要在終末分化細(xì)胞中表迭,在腫瘤組織中極少表達(dá)或不表達(dá);MAGE家族所編碼的蛋白質(zhì)的疏水性最強區(qū)域出現(xiàn)的位置可能與MAGE結(jié)構(gòu)域的功能有關(guān):MAGE家族的成員可能作為

3、細(xì)胞膜上的特異受體,傳遞細(xì)胞外的信號使靶細(xì)胞產(chǎn)生效應(yīng);IAGE家族所編碼的蛋白質(zhì)同源性高區(qū)段的酸堿性與功能域的分布有關(guān):M^GE家族所編碼的蛋白質(zhì)的卷曲螺旋結(jié)構(gòu)可能是通過使蛋白質(zhì)寡聚化而使MAGE結(jié)構(gòu)域活化;mAGE家族所編碼的蛋白質(zhì)具有細(xì)胞支持的作用。MAGE家族編碼蛋自質(zhì)很可能要與其它蛋白質(zhì)聚合形成有功能的球狀結(jié)構(gòu)后,才能行使其功能MAGE—A9具有與MYC蛋白相似的形成異二聚體的功能:MAGEB3在徽體中與氧化酶、過氧化氫酶和過氧

4、化物酶相互協(xié)調(diào)麗發(fā)生作用;盟AGE—Gl具有細(xì)胞支持作用;MAGE—A9、MAGE—A10、MAGE—Bl、MAGE—B4、ⅪAGE—D2與MAGE—D3可能與細(xì)胞膜脂蛋白脂質(zhì)結(jié)合有關(guān):MAGE—A2、MAGEA9、MAGEA11、MAGE—B5、MAGE一32及MAGE—E2屬于具有生物活性,但其內(nèi)在結(jié)構(gòu)是無序的蛋白質(zhì):MAGE—H1與RESDIN也具有類似或部分類似MAGE結(jié)構(gòu)域的功能:MAGE家族同源性高區(qū)段包括除MAGE結(jié)構(gòu)域以

5、外的一些結(jié)構(gòu)域,由此推測MAGE家族蛋白質(zhì)的某些重要功能必須是其它結(jié)構(gòu)域與MAGE結(jié)構(gòu)域共同作用完成的。關(guān)于MAGE家族的CTL表位分析發(fā)現(xiàn):①在lAGE—A2、MAGE—A12蛋白質(zhì)中包含有與MAGEA3,HLA—A2的CTL表位LLIIVLAII相同的多肽序列;②MAGE—A12蛋白質(zhì)中包含有與MAGEA3、HLAA2的CTL表位FLwGPRALV相同的多肽序列;③MAGE—Al、MAGEA2、MAGE—A3、MAGE—A4、MAG

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