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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分鱗翅目昆蟲Cry毒素受體與人類的同名蛋白的生物信息學(xué)分析
背景:
Cry毒素是蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis, Bt)產(chǎn)生的一種殺蟲晶體蛋白,已廣泛應(yīng)用于鱗翅目、雙翅目、鞘翅目、膜翅目等害蟲的生物防治。Cry毒素的殺蟲機(jī)制主要包括細(xì)胞穿孔模型和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞凋亡模型,雖然兩種模型仍有爭(zhēng)議,但Cry毒素受體在兩種模型中都具有重要的作用[1,2,3]。Cry毒素受體主要有氨肽酶 N(a
2、minopeptidase-N, APN)[4]、類鈣黏蛋白(Cadherin-like protein, CaLP)[5]、堿性磷酸酶(alkaline-phosphatase, ALP)[6]和糖脂類[7]。人體同樣存在APN、CaLP、ALP三種蛋白,其與鱗翅目昆蟲Cry毒素受體的異同以及是否具有Cry毒素受體的功能至今鮮見報(bào)道。利用生物信息學(xué)技術(shù)分析鱗翅目昆蟲Cry毒素受體APN、CaLP、ALP與人類的同名蛋白之間的關(guān)系,有利
3、于探討人體內(nèi)是否存在 Cry毒素受體或類似物,為評(píng)價(jià)Cry毒素的安全性提供理論依據(jù)。
目的:
分析鱗翅目昆蟲Cry毒素受體氨肽酶N(APN)、類鈣黏蛋白(CaLP)、堿性磷酸酶(ALP)與人類的同名蛋白之間的關(guān)系,探討人體內(nèi)是否存在Cry毒素受體或類似物。
方法:
從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)獲取人類和鱗翅目昆蟲的APN、CaLP、ALP的氨基酸序列,利用Clustalx1.83、Clustal Omega、
4、MEGA6.0、InterPro、SWISS-MODEL及FATCAT等軟件和在線服務(wù)器對(duì)序列一致性、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、結(jié)構(gòu)域、三維結(jié)構(gòu)相似性等進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。
結(jié)果:
APN系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系最近的是人類與家蠶,兩者序列一致性最高58.06%、含2個(gè)相同的結(jié)構(gòu)域、三維結(jié)構(gòu)相似性顯著(62.80%,P﹤0.05),且兩者都含有潛在的O糖基化和N糖基化位點(diǎn)。ALP系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系最近的是人類與家蠶,兩者序列一致性最高46.03%、含
5、2個(gè)相同的結(jié)構(gòu)域、三維結(jié)構(gòu)相似性顯著(59.63%和59.59%,P﹤0.05)。人類與鱗翅目昆蟲的CaLP系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系較遠(yuǎn);CaLP序列一致性最高是人類與棉鈴蟲(28.12%),兩者含2個(gè)相同的結(jié)構(gòu)域、三維結(jié)構(gòu)相似性不顯著(18.75%, P﹥0.05)。
結(jié)論:
人類和家蠶的APN、ALP系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系最近、序列一致性最高、含有相同的結(jié)構(gòu)域且三維結(jié)構(gòu)相似性顯著;人類與家蠶的APN均含有潛在的O糖基化和N糖基化位點(diǎn)。
6、因此,預(yù)測(cè)人類的APN、ALP與家蠶的APN、ALP可能具有相似的生物學(xué)功能。由于家蠶的APN、ALP具有Cry毒素受體的生物學(xué)功能,因此推測(cè)人類的APN、ALP也可能具有類似Cry毒素受體的功能,但仍需進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
第二部 Cry2Aa蛋白的果蠅表達(dá)體系構(gòu)建
背景:
蘇云金芽孢桿菌產(chǎn)生的 Cry蛋白對(duì)鱗翅目、鞘翅目等昆蟲具有殺蟲活性,因而被作為有效的生物殺蟲劑廣泛應(yīng)用于農(nóng)林業(yè)害蟲的防治。隨著轉(zhuǎn)基因技術(shù)
7、的發(fā)展, Cry蛋白在抗蟲轉(zhuǎn)基因作物的應(yīng)用也越來(lái)越多,目前國(guó)內(nèi)外已成功培育出轉(zhuǎn)基因玉米、水稻、油菜、棉花等多種抗蟲轉(zhuǎn)基因作物。由于外源基因的插入可能會(huì)引起次級(jí)效應(yīng)和位置效應(yīng),因此轉(zhuǎn)基因作物可能存在一些潛在的風(fēng)險(xiǎn)。目前,轉(zhuǎn)基因作物的食用安全性和生態(tài)安全性越來(lái)越受關(guān)注。其中,轉(zhuǎn)基因作物的過(guò)敏原性評(píng)價(jià)是研究重點(diǎn)之一,而獲得一定量的外源蛋白是進(jìn)行過(guò)敏原性評(píng)價(jià)的基礎(chǔ)。另外,我們已經(jīng)通過(guò)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)人類的APN和ALP可能具有類似Cry毒素受體的
8、功能,進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證需要 Cry蛋白作為實(shí)驗(yàn)材料。果蠅表達(dá)系統(tǒng)結(jié)合了昆蟲表達(dá)系統(tǒng)和哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn),減少內(nèi)毒素的影響,能夠直接產(chǎn)生高效且穩(wěn)定表達(dá)外源蛋白的昆蟲細(xì)胞系,具有較好的應(yīng)用前景。
目的:
將Cry2Aa基因克隆進(jìn)果蠅表達(dá)載體pAc5.1/V5-His中,構(gòu)建Cry2Aa-pAc5.1瞬時(shí)轉(zhuǎn)染質(zhì)粒。另外,在Cry2Aa基因的5’端添加一個(gè)帽子結(jié)構(gòu)和Kozak序列從而獲得C2A33目的基因,并將其克隆
9、進(jìn)果蠅表達(dá)載體pMK33/pMtHy中,構(gòu)建C2A33-pMK33穩(wěn)定轉(zhuǎn)染質(zhì)粒。將這兩種重組質(zhì)粒分別采用瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的方法轉(zhuǎn)入果蠅S2細(xì)胞,從而構(gòu)建Cry2Aa蛋白的果蠅表達(dá)體系。表達(dá)的Cry2Aa蛋白可作為評(píng)價(jià)Cry2Aa蛋白過(guò)敏原性及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證人類的APN和ALP是否具有Cry毒素受體功能的實(shí)驗(yàn)材料。
方法:
1、根據(jù)Cry2Aa基因序列和實(shí)驗(yàn)要求設(shè)計(jì)PCR引物,由鉑尚生物技術(shù)(上海)有限公司合成。
10、 2、PCR擴(kuò)增獲得Cry2Aa目的基因,將其克隆進(jìn)pEASY–Blunt Simple Cloning Vector并進(jìn)行菌落PCR和雙酶切鑒定;將鑒定正確的目的基因克隆進(jìn)果蠅表達(dá)載體pAc5.1/V5-His中,構(gòu)建Cry2Aa-pAc5.1瞬時(shí)轉(zhuǎn)染質(zhì)粒,進(jìn)行菌落PCR、雙酶切和測(cè)序鑒定。
3、PCR擴(kuò)增獲得C2A33目的基因,將其克隆進(jìn)pEASY–Blunt Simple Cloning Vector并進(jìn)行菌落 PCR和
11、雙酶切鑒定;將鑒定正確的目的基因克隆進(jìn)果蠅表達(dá)載體pMK33/pMtHy中,構(gòu)建C2A33-pMK33穩(wěn)定轉(zhuǎn)染質(zhì)粒,進(jìn)行菌落PCR、雙酶切和測(cè)序鑒定。
結(jié)果:
1、構(gòu)建了Cry2Aa蛋白的瞬時(shí)轉(zhuǎn)染質(zhì)粒Cry2Aa-pAc5.1。
2、構(gòu)建了Cry2Aa蛋白的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染質(zhì)粒C2A33-pMK33。
結(jié)論:
本研究構(gòu)建了 Cry2Aa蛋白的瞬時(shí)轉(zhuǎn)染質(zhì)粒 Cry2Aa-pAc5.1和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染質(zhì)粒
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