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文檔簡介
1、背景:
自古以來,結(jié)核分枝桿菌(MTB)作為一種具有極強傳染性的微生物,引起的結(jié)核病一直威脅著人類以及許多其他動物的健康。據(jù)最新統(tǒng)計,全球新增約960萬人/年感染活動性結(jié)核桿菌,有近150萬人/年死于結(jié)核病及其相關(guān)并發(fā)癥。在感染初早期快速且準(zhǔn)確的檢出結(jié)核桿菌及早開始治療可大大降低結(jié)核在人群中的播散。作為近幾年來快速發(fā)展的、可檢測抗原特異度細胞免疫應(yīng)答反應(yīng)的新技術(shù),ELISP OT已被證明可用于診斷結(jié)核的活動性與潛伏性感染。但基
2、于該原理的診斷試劑鮮有新的改進。主要由于該檢驗方法的主要影響條件尚不夠明確。全基因組表達譜芯片技術(shù)是近幾年來逐步發(fā)展成熟的一種可以在同一時間檢測大量基因的表達的新的檢測方法,其具有高通量和高靈敏性的特性。當(dāng)前主要的研究集中在ELISPOT是否可以正確快速的診斷不同人群、不同種類的結(jié)核,對于如何提高其診斷性能的研究較少。
目的:
驗證重組特異性蛋白ESAT-6及CFP-10的生物活性,建立具有較高靈敏度和特異性的ELI
3、SPOT方法。以基因芯片為基礎(chǔ),通過生物信息結(jié)果分析探討影響結(jié)核特異性蛋白ESAT-6及CFP-10作用于特異性T淋巴細胞的主要機制。
方法:
以聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增CFP-10及ESAT-6基因片段,構(gòu)建原核表達重組質(zhì)粒。重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達后通過親和層析法純化CFP10和ESAT6重組蛋白,分別分析其蛋白純度。通過條件梯度的摸索建立可應(yīng)用于臨床的ELISPOT方法確定適合的ELISPOT方法實
4、驗條件。
通過磁珠分選技術(shù)分選出CD4陽性的淋巴細胞,選取合適的表達譜基因芯片,篩選出蛋白刺激前后顯著差異表達的基因位點,根據(jù) GO分析及 KEGG分析,預(yù)測其對應(yīng)的通路。為今后的實驗建立起對應(yīng)的結(jié)構(gòu)布局。
結(jié)果:
1.本實驗室現(xiàn)已構(gòu)建穩(wěn)定的特異性蛋白表達體系,根據(jù)實驗條件建立了ELISOPT技術(shù)檢測結(jié)核桿菌感染的一系列實驗步驟。
2.與T-Spot試劑盒進行對比,ELISPOT的特異度與靈敏度分
5、別為82.35%和88.50%(χ2=0.57,P>0.05),差異無統(tǒng)計學(xué)意義。
3.通過芯片檢測刺激前后結(jié)核病人T細胞的差異位點,CFP-10刺激后表達上升相對應(yīng)基因參與BP的GO條目共1138條,參與CC的GO條目共31條,參與MF的GO條目共59條;表達下降相對應(yīng)基因參與BP條目共1273條,參與CC條目共154條,參與MF條目共181條。ESAT-6刺激后表達上升相對應(yīng)基因參與BP的GO條目共1295條,參與CC的G
6、O條目共112條,參與MF的GO條目共71條;表達下降相對應(yīng)基因參與BP條目共1089條,參與CC條目共112條,參與MF條目共139條。
4.聯(lián)合KEGG與差異表達基因的分析,上升和下降的通路中,CFP-10組與結(jié)核及IFN-γ相關(guān)的信號通路如下細胞因子受體相互作用、Toll樣受體、JAK-STAT、細胞粘附等;ESAT-6組與結(jié)核及IFN-γ相關(guān)的信號通路如下JAK-STAT、Toll樣受體、NF-κB、PI3K-Akt等
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