IRF-5基因多態(tài)性與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的相關性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:干擾素調(diào)節(jié)因子(interferon regulation factor,IRF)家族是與干擾素基因的順式元件及ISG序列中的干擾素刺激性反應元件(IFN-stimulatedresponse element,ISRE)相互作用,可調(diào)節(jié)干擾素及干擾素相關誘導基因的表達的一類轉(zhuǎn)錄因子,IRF家族和IFN是調(diào)控存在相互性,有研究證明IRF-5在系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病中可能有重要作用,其多態(tài)性存在種族差異。本研究針對山東省漢族人群IRF-5

2、基因rs2004640、RF-5基因rs10954213等位點的單核苷酸多態(tài)性進行分析,探究IRF5基因和誘發(fā)系統(tǒng)性紅斑狼瘡的相關性:(1)檢測山東漢族IRF-5基因rs2004640位點單核苷酸多態(tài)性的分布情況,并分析其與SLE易感性之間的關系。(2)檢測山東漢族IRF-5基因rs10954213位點單核苷酸多態(tài)性的分布情況,并分析其與SLE易感性之間的關系。
   方法:實驗組:收集92例SLE患者來自2007年4月至200

3、8年11月月青島市市立醫(yī)院門診及住院病人,92例病例均為按1997年美國風濕病學會指定的SLE診斷標準確診病例,正常對照組:88例,排除糖尿病、類風濕性關節(jié)炎、腎小球腎炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡等自身免疫病的青島市立醫(yī)院健康體檢者,對照組人員之間均無親緣關系,均為山東漢族。各組樣本分離外周血單個核細胞后,采用UltraPure基因組DNA快速提取試劑盒(Promega公司)提取基因組DNA;參照序列GenBank中IRF-5的DNA序列(編號為

4、NC000007.12)用primer5.0設計引物;PCR擴增IRF-5基因rs2004640、rs10954213位點相關序列,產(chǎn)物純化后分別采用內(nèi)切酶TaiⅠ酶、FspBⅠ酶進行酶切,然后進行限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)分析,并計算基因型和等位基因頻率。
   結(jié)果:(1)SLE患者IRF5基因rs200464位點基因型有GG、GT、TT三種類型,其基因型頻率分別是0.198、0.521和0.281,等位基因G的頻率為

5、0.402,等位基因T的頻率為0.598;對照組三種基因型的頻率分別是0.214、0.487和0.299,等位基因G和T的頻率分別0.705和0.295。兩組基因型及等位基因構(gòu)成比差異有統(tǒng)計學意義(x2=8.73,P<0.05;x2=7.41,P<0.01);(2)IRF5基因rs109542位點基因型有GG、GA,AAZ種類型,其基因型頻率分別是0.163、0.457和0.380,等位基因G的頻率為0.391,等位基因A的頻率為0.6

6、09;對照組三種基因型的頻率分別是0.318、0.409和0.273,等位基因G和A的頻率分別0.602和0.398。兩組基因型及等位基因構(gòu)成比差異有統(tǒng)計學意義(x2=6.36,P<0.05;x2=6.26,P<0.05);
   結(jié)論:IRF-5基因rs2004640在山東漢族人群存在單核苷酸多態(tài)性,可能為SLE的易感基因;IRF-5基因rs10954213在山東漢族人群存在單核苷酸多態(tài)性,可能為SLE的易感基因。
  

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