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文檔簡介
1、目的
系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SystemicLupusErythematosus,SLE)是一種全身多系統(tǒng)受累的慢性進行性、反復發(fā)作的自身免疫性疾病。SLE屬于多基因復合性疾病[1],臨床表型具有相當大的異質(zhì)性,可累及皮膚、粘膜、腎、肺、心臟、關(guān)節(jié)、血液系統(tǒng)等。其病因和發(fā)病機制尚未明確,大量研究表明,SLE的發(fā)生發(fā)展與遺傳因素、性激素、感染、環(huán)境誘發(fā)因素以及機體免疫功能絮亂等因素有關(guān)。目前一般認為SLE發(fā)病時激素和環(huán)境因素觸發(fā)了具有
2、遺傳易感性的個體發(fā)生免疫學異常,尤其是體液免疫密切相關(guān),主要涉及T淋巴細胞、B淋巴細胞、自然殺傷細胞、單核細胞等幾乎所有的單個核細胞和多細胞因子網(wǎng)絡(luò)[2]。近年來,在髓系和淋巴系特異性表達的溶酶體相關(guān)跨膜蛋白5(LAPTM5)作為LAPTM家族的一員受到國內(nèi)外學者關(guān)注[3]。LAPTM5是TCR和BCR的調(diào)節(jié)器[4,5],其介導受體的降解與某些自身免疫性疾病相關(guān)[6,7]。我們的前期研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),在高度表達的LAPTM5的MRL/Ipr
3、小鼠中形成狼瘡樣腎炎。(LupusNephritis,LN)樣改變。位于染色體1p34,在骨髓系和淋巴系特異性表達LAPTM5蛋白的基因單核苷酸多態(tài)性(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)與SLE發(fā)病可能有一定的相關(guān)性。
為進一步研究LAPTM5基因多態(tài)性與SLE之間的關(guān)系,我們以中國漢族人群為研究對象,我們利用數(shù)據(jù)庫HapMap(http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov)和軟
4、件Haploview4.2對其(包含5'上游-4000bp)進行多態(tài)分析,篩選出在中國漢族人群(CHB)中次要等位基因頻率(Minorallelefrequency,MAF)大于0.1的其中1個標簽位點(TagSNP)。應(yīng)用聚合酶連反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性分析(PCR-RFLP)方法比較LAPTM5基因SNP在SLE病例組和健康對照組的分布,探討LAPTM5基因與SLE發(fā)病的相關(guān)性。
材料和方法
一、實驗材料
5、> ?。ㄒ唬┭芯繉ο?br> 分析來自于1999-2004年中國醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院SLE并患狼瘡腎炎的住院患者與中國醫(yī)科大學體檢中心健康人群血樣,病例組SLE患者281例,男25例,女256例,其診斷根據(jù)1982年美國風濕病學會(ACR)修訂的SLE分類標準;對照組健康患者360例,其中男35例,女325例。2組的年齡、性別比例差異無統(tǒng)計學差異、并且全部研究對象無血緣關(guān)系。
?。ǘ┲饕噭?br> 紅細胞裂解液、DNA裂
6、解液、TE緩沖液、乙醇,75%乙醇、TENZOL液(Takara)LAPTM5引物(上海生工)、TBE緩沖液、PCR試劑盒(上海生工)、測序試劑盒(ABI公司)、6×LoadingBuffer,核酸染料,10×NEBUffer2,XcmI、水浴箱,PCR擴增儀(AppliedBiosystemsGeneAmpPCR9700),石蠟、深低溫冰箱、凝膠紫外燈、DNA回收試劑盒等。
二、試驗方法
采用聚合酶連反應(yīng)-限制性片
7、段長度多態(tài)性分析(PCR-RFLP)方法分析中國漢族人群LAPTM5基因單核苷酸多態(tài)性,通過計算LAPTM5基因的基因型和等位基因頻率在SLE病例組和健康對照組中的分布,進而研究LAPTM5基因與SLE相關(guān)性。
三、測序方法
應(yīng)用Run3130軟件設(shè)定的程序進行自動化電泳,序列分析軟件V5.1進行序列分析,設(shè)定雜合峰高大于25%的為雜合序列。通過Blast與基因數(shù)據(jù)庫標準序列進行比對,獲得基因多態(tài)性信息。
8、四、統(tǒng)計學分析
采用卡方檢驗,并運用SPSS軟件對SLE病例組和健康對照組基因型頻率進行統(tǒng)計學分析,判斷LAPTM5基因多態(tài)性與SLE易感性有無關(guān)聯(lián)。P<0.05有統(tǒng)計學意義。
結(jié)果
在LAPTM5基因A(rs1188348)G位點為1個有義SNP位點,該位點存在3中基因型,即A/G型、G/G型、A/A型。各型在SLE病例組和健康對照組中的分布差異無統(tǒng)計學意義。
結(jié)論
LAPTM5基因S
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