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文檔簡介
1、目的:研究慢加急性肝衰竭患者體內(nèi)HBV前C/C區(qū)準(zhǔn)種的分布特征,從HBV群體異質(zhì)性角度探討肝衰竭的發(fā)病機(jī)制。
方法:選擇慢加急性肝衰竭患者10例為研究對(duì)象,以慢性乙型肝炎患者10例為對(duì)照組,取入組患者血清,抽提HBV DNA,巢式PCR擴(kuò)增HBV前C/C區(qū)基因,將PCR產(chǎn)物純化回收后進(jìn)行T-A克隆,通過基因測序方法得到陽性克隆的基因序列,應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析比較慢加急性肝衰竭組和慢性乙型肝炎組之間準(zhǔn)種特征的差異。對(duì)于病毒
2、準(zhǔn)種的異質(zhì)性,可以從準(zhǔn)種復(fù)雜度和準(zhǔn)種多樣性兩方面進(jìn)行量化分析。為了明確準(zhǔn)種復(fù)雜度和多樣性與HBV DNA載量是否存在相關(guān)性,對(duì)其進(jìn)行person相關(guān)性分析。另外,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹分析兩組間HBV進(jìn)化模式的差異。
結(jié)果:兩組的HBV 準(zhǔn)種構(gòu)成情況不同,慢加急性肝衰竭患者組的準(zhǔn)種復(fù)雜度(包括核苷酸水平和氨基酸水平)和準(zhǔn)種多樣性(平均遺傳距離和平均非同義替換位點(diǎn)數(shù))均大于慢性乙型肝炎患者組(P<0.05)。準(zhǔn)種復(fù)雜度和多樣性與HB
3、V 載量無明顯相關(guān)性(P>0.05)。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示來自同一患者的序列聚在一起,僅少數(shù)序列會(huì)嵌合在其他患者的序列簇中;來自肝衰竭組的序列分支長度比慢乙肝組的長。
結(jié)論:慢加急性肝衰竭組的準(zhǔn)種構(gòu)成情況較慢性乙型肝炎組復(fù)雜,肝衰竭組的準(zhǔn)種異質(zhì)性的量化指標(biāo)(包括準(zhǔn)種復(fù)雜度和多樣性)亦均大于慢性乙型肝炎組,復(fù)雜的HBV準(zhǔn)種分布特征可能導(dǎo)致HBV感染重癥化,乃至肝衰竭發(fā)生。
HBV在慢加急性肝衰竭組和慢乙肝組表
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