多基因異常甲基化與不同分子亞型乳腺癌關(guān)系的初步研究.pdf

1、目的:
　　DNA異常甲基化是乳腺癌早期發(fā)生的重要機(jī)制之一。乳腺癌是一類分子上具有高度異質(zhì)性的惡性腫瘤，即使組織形態(tài)相同的乳腺癌其分子遺傳學(xué)改變也不盡相同，即具有不同的分子分型。本實(shí)驗(yàn)的目的在于研究多個基因在不同分子亞型乳腺癌中的甲基化水平，探討基因的甲基化與乳腺癌分子亞型的關(guān)系。
　　方法:
　　本研究從大量文獻(xiàn)搜索中篩選了48個在乳腺癌發(fā)病通路中重要的候選靶基因，應(yīng)用Access Array納米微流體PCR芯片和第

2、二代深度測序技術(shù)結(jié)合亞硫酸氫鈉測序法，在83例的乳腺癌患者腫瘤組織及配對正常組織中分析48個靶基因的DNA甲基化水平。根據(jù)樣本的不同分子亞型，在Gene水平進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。采用的方法為Kruskal-Wallis Rank Sum Test，并對所得P值采用了FDR的方法進(jìn)行校正。
　　結(jié)果:
　　我們成功地對48個靶基因中的45個基因進(jìn)行了測序，其中3個基因由于引物擴(kuò)增效率問題沒有結(jié)果。1、Luminal A型組、Lum

3、inal B型組、HER2過表達(dá)型組、Basal-like型組的綜合甲基化水平分別為:0.054±0.036、0.060±0.035、0.034±0.033、0.017±0.016，P=0.012＜0.05，差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。且Luminal A型組、Luminal B型組的整體甲基化水平明顯高于HER2過表達(dá)型組、Basal-like型組。2、對45個靶基因在不同分子亞型乳腺癌中的甲基化水平分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，我們發(fā)現(xiàn)有以下3個基因