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文檔簡介
1、志賀氏菌(Shigella)是引起食物中毒的常見致病菌之一,引起食物中毒的食品多為肉類,乳制品等蛋白質(zhì)含量多的食品。目前,國內(nèi)檢測食品中志賀氏菌仍采用傳統(tǒng)的方法,其操作繁瑣,檢測時間長,通常需要3~5 d。本研究建立了一套用LAMP技術(shù)快速檢測志賀氏菌的方法,縮短了檢測時間,提高檢測方法的靈敏性。
FTA卡是用螯合劑和變性劑浸泡過的纖維基質(zhì),他可以在接觸微生物時將其吸附并裂解細(xì)胞,使DNA吸附在纖維基質(zhì)上。FTA可以高效、
2、快速、低損耗的提取DNA。本研究將FTA與環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(LAMP)方法相結(jié)合,檢測志賀氏菌。
本研究針對志賀氏菌的特異基因ipaH設(shè)計引物,用LAMP引物在線設(shè)計軟件設(shè)計引物,對內(nèi)引物濃度、外引物濃度、Mg2+濃度、Bst酶濃度等反應(yīng)條件進行了優(yōu)化,建立LAMP反應(yīng)體系。
LAMP反應(yīng)體系如下:F3與B3(LAMP反應(yīng)外引物)各0.2 mM;BIP與FIP(LAMP反應(yīng)內(nèi)引物)0.8 mM;其它反應(yīng)組分終濃
3、度分別為:0.3 mM dNTP,0.3 mM MgCl2,2.5 μL ThermoPol buffer(20 mMTris-HCl(pH8.8,25℃),10 mM KCl,10 mM(NH4)2SO4,2 mM MgSO4,0.1%1.Triton X-100),0.5 μL(8U)Bst大分子聚合酶,1 μL 目標(biāo)DNA,純水補足體積到25 μL。擴增反應(yīng)條件為62℃保存1 h,80 2 ℃ min使酶滅活。
本研
4、究通過LAMP方法檢測純菌液及人工污染豬肉對LAMP反應(yīng)的最小檢出限進行確定。結(jié)果表明:LAMP在反應(yīng)過程中,能夠產(chǎn)生大量的肉眼可見的焦磷酸鎂沉淀。LAMP對菌懸液的最低檢出濃度為62 CFU/mL,傳統(tǒng)的PCR方法對菌懸液的最低檢出濃度620 CFU/mL。LAMP對豬肉中志賀氏菌的最低檢出量為42 CFU/mL。LAMP法擴增最短可在20min內(nèi)完成,對豬肉中志賀氏菌的檢測的整個檢測過程(包括DNA提取1 h、LAMP反應(yīng)30 mi
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