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文檔簡介
1、【背景】
胰腺癌(pancreatic cancer,PC)是惡性程度最高的腫瘤之一,其中,胰腺導(dǎo)管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)占90%以上。由于早期臨床癥狀隱匿,診斷困難,絕大部分PDAC患者在確診時腫瘤已出現(xiàn)轉(zhuǎn)移或侵襲到胰外器官而無法行根治性手術(shù)切除;此外,PDAC對放療和化療均不敏感,患者的中位生存時間不到6個月,5年生存率小于5%,預(yù)后極差。近年來,我國及西方國家的
2、PDAC發(fā)病率及死亡率均呈上升趨勢。隨著生物技術(shù)的迅速發(fā)展,PDAC的相關(guān)分子生物學(xué)研究對于闡明PDAC發(fā)病機制,提高PDAC診治水平,改善患者預(yù)后具有重要意義。
MicroRNA(miRNA)是由17~25個核苷酸所組成的非編碼小分子單鏈RNA,具有高度保守性,通過與靶基因mRNA的3’端的非翻譯區(qū)(3’-UTR)結(jié)合,降解或者抑制mRNA的翻譯,實現(xiàn)對靶基因的負調(diào)控。研究發(fā)現(xiàn),miRNAs在許多生物學(xué)進程中發(fā)揮重要作用,其
3、異常表達與多種疾病相關(guān)。在腫瘤研究領(lǐng)域,miRNAs涉及腫瘤發(fā)生、發(fā)展代謝、耐藥等多個方面,并具有組織特異性,通過調(diào)控眾多腫瘤相關(guān)基因的表達,發(fā)揮類似于原癌基因或者抑癌基因的作用。目前,有關(guān)miRNAs在PDAC的研究涵蓋了腫瘤細胞增殖、凋亡、分化、侵襲轉(zhuǎn)移和耐藥等方面。對比分析PDAC細胞系、組織樣品、體液及小動物模型相對于正常組的miRNA表達譜變化,發(fā)現(xiàn)其表達譜存在顯著差異,一部分miRNAs的表達上調(diào),如miR-21,miR-1
4、55,miR-10b,miR-196,miR-221,miR-301,miR-95等,而另一些miRNAs則表達下調(diào),如miR-217,miR-216,miR-375,miR-203等。這些異常表達的miRNAs調(diào)控的靶基因有KRAS,PTEN,PDCD4,ZEB1,BCL-2,TIMP3等等。但是現(xiàn)階段的研究仍存在很多尚未闡明的問題,關(guān)于PDAC中miRNAs及其靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和作用機制方面還需進一步的研究。miR-135a被證
5、實在許多腫瘤中發(fā)揮抑制腫瘤細胞增殖,促進腫瘤細胞凋亡等作用,但在胰腺癌中的作用尚未見有相關(guān)研究。
Bmi1(B-ceIl-specific Moloney murine leukemia virus integration site1)基因,屬于多梳基因PcG(polycomb group genes)家族。Bmi1基因在細胞周期、細胞永生化和衰老的調(diào)解中發(fā)揮重要作用。近年來,許多研究證實了Bmi1基因還參與了干細胞的自我更新
6、和分化。Bmi1基因與腫瘤關(guān)系密切,通常被認為是一個重要的癌基因。肺癌、乳腺癌、白血病、淋巴瘤、肝癌和胰腺癌等多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展都和Bmi1的異常表達有關(guān)。通過生物信息學(xué)預(yù)測與分析,我們推測Bmi1基因是miR-135a的潛在靶基因之一。
miR-135a是否參與PDAC的發(fā)生和發(fā)展?其在PDAC中的功能是什么?這些功能是否是通過調(diào)控Bmi1來實現(xiàn)的?因此,miR-135a在PDAC發(fā)生、發(fā)展中的作用和機制還需進一步研究。
7、r> 【目的】
通過miRNA表達譜芯片篩選 PDAC細胞系及正常胰腺導(dǎo)管上皮細胞系中發(fā)生差異表達的miRNA分子,確定研究對象(即 miR-135a)后探討其在 PDAC發(fā)生發(fā)展中的相關(guān)功能和機制,為PDAC的診療尋找新的靶點。
【方法】
1.本實驗選用高通量的Agilent Human microRNA array kit(V18.0)檢測3種PDAC細胞系(PANC-1、BxPC-3和ASPC-1)
8、及1種正常胰腺導(dǎo)管上皮細胞系(HPDE6c7)中的miRNAs表達情況。并采用實時定量PCR(qRT-PCR)的方法在腫瘤組織及細胞系中驗證部分差異表達的miRNAs,結(jié)果證明芯片檢測準確、可靠,并且挑選miR-135a作為研究對象。
2.構(gòu)建過表達miR-135a的慢病毒載體Lenti-miR-135a,轉(zhuǎn)染PDAC細胞系,通過細胞計數(shù)試劑盒(Cell Counting Kit-8,CCK-8),克隆形成實驗、EdU細胞增殖
9、檢測實驗、流式細胞術(shù)、Transwell實驗及 Matrigel實驗等方法觀察其對細胞增殖、生長、侵襲和遷移的影響。并通過裸鼠皮下成瘤實驗來觀察miR-135a對PDAC增殖能力的影響。
3.miR-135a下游靶基因的預(yù)測、驗證及相關(guān)機制研究:利用 miRanda、Pita,及 RNAhybrid等靶基因預(yù)測軟件,結(jié)合相關(guān)因素進行分析,篩選出 Bmi1可能為miR-135a的下游靶基因。在PDAC細胞中過表達或抑制miR-1
10、35a后利用實時定量RT-PCR和免疫印跡實驗(western blotting)檢測Bmi1基因mRNA和蛋白水平的改變。之后采用熒光素酶報告實驗驗證miR-135a對Bmi1的調(diào)控作用。然后,western blotting檢測上述轉(zhuǎn)染細胞中細胞周期及凋亡相關(guān)分子p21,cyclin D1,Cdk2,Cdk4,Akt,pAkt,Bcl-2,Bax的變化。
【結(jié)果】
1.Agilent human miRNA芯片檢
11、測結(jié)果顯示,與正常胰腺導(dǎo)管上皮細胞系相比,PDAC細胞系中表達上調(diào)的miRNA有23個(fold change>2),包括 miR-21,miR-10a-5p,miR-10b-5p和miR-301a-3p等,表達下調(diào)的有43個(fold change<0.5),如miR-205-3p,miR-203,miR-630以及miR-135a等。結(jié)合既往文獻報道的差異表達的miRNAs,芯片檢測結(jié)果可準確性及可靠性高。通過芯片篩選及查閱相關(guān)文獻
12、,我們發(fā)現(xiàn) miR-135a在肺癌、腎癌、胃癌等惡性腫瘤中的表達均有明顯的降低并和細胞增殖、凋亡等惡性表型相關(guān),但是在PDAC中的表達變化及其功能未見報道。所以我們選擇 miR-135a作為進一步的研究對象。為驗證芯片篩選結(jié)果,我們還采用實時定量RT-PCR對miR-135a在PDAC細胞系及組織中的表達狀況進行了驗證,發(fā)現(xiàn)相較于癌旁正常組織和正常胰腺導(dǎo)管上皮細胞系,miR-135a在 PDAC組織和細胞系的表達均顯著下調(diào),結(jié)果與芯片結(jié)
13、果相一致。提示miR-135a在 PDAC的發(fā)生發(fā)展過程中可能發(fā)揮重要作用。
2.轉(zhuǎn)染Lenti-miR-135a后,采用CCK-8檢測細胞生長曲線結(jié)果提示,與對照組相比,轉(zhuǎn)染組細胞增殖能力減弱;平板克隆形成實驗結(jié)果提示,與對照組相比,轉(zhuǎn)染組細胞克隆形成能力減弱;EdU實驗結(jié)果提示,與對照組相比,轉(zhuǎn)染組細胞增殖能力減弱。流式細胞儀檢測細胞周期與細胞凋亡實驗結(jié)果提示,與對照組相比,轉(zhuǎn)染組細胞增加了G0?G1期細胞的比例,G2/M
14、期的細胞的比例下降,并且增加了凋亡細胞的數(shù)量。裸鼠皮下成瘤實驗提示,與對照組相比,注射轉(zhuǎn)染組細胞的裸鼠成瘤能力顯著減弱。Transwell小室實驗的結(jié)果則提示miR-135a對PDAC細胞的遷移與侵襲能力無明顯影響。
3.生物信息學(xué)預(yù)測提示,Bmi1可能是miR-135a作用的靶基因之一,采用western blotting檢測 PDAC細胞系及組織中的Bmi1基因的蛋白表達情況,發(fā)現(xiàn)其表達與miR-135a的表達呈負相關(guān)。過
15、表達或抑制 miR-135a對 Bmi1基因的mRNA水平無明顯影響,但卻對其蛋白水平則呈負性調(diào)控作用。熒光素酶報告基因?qū)嶒炞C實miR-135a可以抑制含有其結(jié)合位點的報告基因的活性,而對含突變位點的質(zhì)粒及對照質(zhì)粒沒有影響。進一步驗證了生物信息學(xué)軟件的預(yù)測結(jié)果。
4.western blotting檢測PDAC細胞中細胞周期相關(guān)分子p21,cyclin D1,Cdk2,Cdk4的變化。發(fā)現(xiàn)與對照組相比較,過表達miR-135a
16、后細胞中cyclin D1,Cdk2,Cdk4的表達明顯下調(diào),p21的表達則上調(diào)。而同時轉(zhuǎn)染 miR-135a mimics與pcDNA-Bmi1(mutant3’-UTR for miR-135a)后,與僅過表達miR-135a組細胞相比,上調(diào)了cyclin D1,Cdk2,Cdk4的表達,p21的表達則下調(diào)。western blotting檢測細胞凋亡相關(guān)分子表達發(fā)現(xiàn),與對照組相比較,過表達miR-135a后細胞中phospho-A
17、kt和Bcl-2的表達受到抑制,Bax表達水平則升高,同時轉(zhuǎn)染 miR-135a mimics與pcDNA-Bmi1(mutant3’-UTR for miR-135a)后,與僅過表達miR-135a組細胞相比,phospho-Akt和Bcl-2表達升高,Bax的表達被抑制。
【結(jié)論】
1.高通量 miRNA芯片檢測結(jié)果及實時定量 RT-PCR實驗提示 miR-135a在PDAC細胞系和組織中的表達較正常胰腺導(dǎo)管上皮
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