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文檔簡(jiǎn)介
1、背景和目的:
結(jié)直腸癌是我國(guó)第4位最常見(jiàn)的惡性腫瘤,發(fā)病率呈現(xiàn)出逐年上升和逐漸年輕化的趨勢(shì),而導(dǎo)致結(jié)直腸癌患者死亡的主要原因則是腫瘤的轉(zhuǎn)移。腫瘤轉(zhuǎn)移是一個(gè)復(fù)雜的、多步驟的、多階段的過(guò)程,每個(gè)階段都受多種基因或者蛋白的調(diào)節(jié),其中最重要的改變就是腫瘤細(xì)胞運(yùn)動(dòng)行為和運(yùn)動(dòng)能力的增強(qiáng),這也是是其侵襲和轉(zhuǎn)移必不可少的。腹膜轉(zhuǎn)移是結(jié)直腸癌比較常見(jiàn)的轉(zhuǎn)移方式,有文獻(xiàn)報(bào)道約13%的結(jié)直腸癌患者會(huì)發(fā)生腹膜轉(zhuǎn)移,在首次手術(shù)時(shí)發(fā)現(xiàn)有腹膜轉(zhuǎn)移的幾率
2、大約有7%,另有4%~19%的結(jié)直腸癌患者在根治術(shù)后也會(huì)出現(xiàn)腹膜轉(zhuǎn)移。腹膜轉(zhuǎn)移的發(fā)生使結(jié)直腸癌患者預(yù)后很差,只有5~9個(gè)月的中位生存期,因此,篩查結(jié)直腸癌腹膜轉(zhuǎn)移相關(guān)的生物學(xué)標(biāo)記物不僅對(duì)早期診斷及判斷預(yù)后具有重要意義,而且有利于闡明結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移的分子機(jī)理,還能為臨床診治、藥物篩選及預(yù)后判斷提供新的靶點(diǎn)。
隨著人類(lèi)基因組計(jì)劃(Human genome project)的實(shí)施和分子生物學(xué)有關(guān)學(xué)科的迅猛發(fā)展,越來(lái)越多的動(dòng)植物、微
3、生物基因組序列得以測(cè)定,基因序列數(shù)據(jù)正在飛速的迅速增長(zhǎng)?;蛐酒ㄓ址Q(chēng)DNA芯片、生物芯片)技術(shù)就是順應(yīng)這一科學(xué)發(fā)展要求的產(chǎn)物。基因芯片由于其具有高速度、高通量、集約化和低成本的特點(diǎn),被廣泛用于胰腺癌卵巢癌、乳腺癌、胃癌以及結(jié)直腸癌等不同癌組織差異表達(dá)基因的篩查。同樣,在結(jié)直腸癌原發(fā)灶和肝臟、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶之間也存在著大量差異表達(dá)的基因,但腹膜轉(zhuǎn)移組織和原發(fā)腫瘤組織中有哪些基因存在表達(dá)差異,國(guó)內(nèi)外報(bào)道甚少。因此,借助于基因芯片技術(shù)比較結(jié)直
4、腸癌原發(fā)腫瘤組織與腹膜轉(zhuǎn)移組織全基因組mRNA表達(dá)水平的差異,就可以找到結(jié)直腸癌腹膜轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因。
為此,我們采用基因芯片技術(shù)比較4對(duì)結(jié)直腸腺癌原發(fā)腫瘤組織和與之配對(duì)的腹膜轉(zhuǎn)移組織全基因組表達(dá)水平的差異,通過(guò)倍數(shù)法確定差異表達(dá)的基因,并對(duì)這組基因進(jìn)行功能注釋聚類(lèi)分析。我們通過(guò)對(duì)腫瘤進(jìn)展相關(guān)的功能類(lèi)中基因的分析,探討結(jié)直腸癌腹膜轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制。由于基因芯片技術(shù)有一定的假陽(yáng)性率,因此我們對(duì)部分基因芯片技術(shù)篩選出的差異表達(dá)基因
5、進(jìn)行RT-PCR驗(yàn)證。根據(jù)以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果,我們最終確定膠原三股螺旋重復(fù)蛋白1(Collagen TripleHelix Repeat Containing1,CTHRC1)可能與結(jié)直腸癌腹膜種植轉(zhuǎn)移相關(guān),作為下一步試驗(yàn)的目的基因。
CTHRC1最早是在篩查大鼠球囊損傷動(dòng)脈和正常動(dòng)脈之間差異基因的時(shí)候發(fā)現(xiàn)的,在大鼠成纖維細(xì)胞隨著CTHRC1表達(dá)量的提高運(yùn)動(dòng)能力也相應(yīng)提高。在許多人類(lèi)實(shí)體癌中也有CTHRC1高表達(dá)的報(bào)道。最近在有
6、一些研究也主要集中在CTHRC1和消化道腫瘤之間的關(guān)系,比如食管癌、胃癌和腸癌等。CTHRC1是wnt蛋白的輔助因子,他能通過(guò)穩(wěn)定wnt蛋白與他在胞膜上受體的結(jié)合從而發(fā)揮選擇性激活wnt/pcp通路的作用。Wnt/pcp通路的激活使得他的下游小鳥(niǎo)苷三磷酸酶(small GTPases)的活性增強(qiáng),尤其是Rac1和RhoA。Ras GTPases超家族包含了Rho GTPases亞群,在所有的RhoGTPases中,對(duì)Rac1(Ras-r
7、elatedC3 botulinum toxin substrate),Cdc42(cell division cycle42) and RhoA(Rashomolo-gous member A)的研究最為廣泛。Rac1的激活主要促進(jìn)癌細(xì)胞的遷移和浸潤(rùn),RhoA的激活主要降低癌細(xì)胞間粘附能力,促進(jìn)癌細(xì)胞的遷移和轉(zhuǎn)移。
MiRNAs是廣泛存在的,大小約21~25個(gè)堿基的非編碼微小RNA,他們通過(guò)與目的基因的信使RNA3'非翻
8、譯區(qū)結(jié)合而抑制基因表達(dá)來(lái)發(fā)揮作用。MiRNAs與目的基因的信使RNA3'非翻譯區(qū)的相互作用可以導(dǎo)致目的基因信使RNA翻譯被抑制或者降解。已有大量文獻(xiàn)報(bào)道m(xù)iRNA在人類(lèi)癌癥中有異常表達(dá),miRNA通過(guò)靶定促癌或者抑癌基因,發(fā)揮著類(lèi)似腫瘤抑制因子或者促癌因子的作用。另有研究進(jìn)一步證明miRNA與腫瘤的侵襲、轉(zhuǎn)移也有關(guān)系,這一發(fā)現(xiàn)為腫瘤轉(zhuǎn)移的診斷和治療提供了新的切入點(diǎn)。目前關(guān)于miR-520家族的的研究并不是很多,對(duì)其主要主要研究成果集中在
9、了乳腺癌。有文獻(xiàn)指出miR-520d在乳腺癌中與HER2/nue受體有相互作用的關(guān)系。還有文獻(xiàn)指出miR-520c在乳腺癌中由于可以調(diào)控TGF-β和NF-κB通路,在乳腺癌的發(fā)展過(guò)程中起到一個(gè)抑癌基因的作用。在其他癌癥組織中尚未發(fā)現(xiàn)有關(guān)miR-520d的報(bào)道。
因此本文的研究目的是明確CTHRC1在結(jié)直腸癌中的表達(dá)特性,探討CTHRC1促進(jìn)結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移的機(jī)制,初步探討對(duì)miR-520d與CTHRC1在結(jié)直腸癌中關(guān)系。
10、> 方法及結(jié)果:
(一)基因芯片篩查差異表達(dá)基因2009年6月到2010年4月在中國(guó)廣州南方醫(yī)科大學(xué)附屬南方醫(yī)院手術(shù)治療結(jié)直腸腺癌伴腹膜種植轉(zhuǎn)移病人4例,術(shù)中收集原發(fā)腫瘤組織和腹膜轉(zhuǎn)移組織標(biāo)本,浸泡于于RNA Later中常溫保存。應(yīng)用Trizol法提取總mRNA,經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA后經(jīng)體外擴(kuò)增合成aRNA后用Cy3熒光分子標(biāo)記,標(biāo)記后與人類(lèi)全基因組表達(dá)譜芯片雜交,待芯片完全干燥后,利用掃描儀(LuxScan3.0
11、,北京博奧)進(jìn)行掃描,掃描后將圖像轉(zhuǎn)化為基于熒光強(qiáng)度的數(shù)字信號(hào)(GenePix Pro6.0),隨后進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和處理。采用倍數(shù)法(≥2或≤0.5)確定配對(duì)標(biāo)本間差異表達(dá)基因,通過(guò)DAVID(The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)分析工具對(duì)這組差異表達(dá)基因進(jìn)行基因功能的注釋和基因富集分析,篩選出與腫瘤進(jìn)展相關(guān)的功能類(lèi),在這些功能類(lèi)中挑選差異
12、倍數(shù)較高且參與多個(gè)功能類(lèi)的基因進(jìn)行半定量熒光RT-PCR驗(yàn)證。根據(jù)試驗(yàn)結(jié)果及文獻(xiàn)報(bào)道最后決定將膠原三股螺旋重疊蛋白1(collagen triple helix repeat containing1,CTHRC1)作為繼續(xù)研究的對(duì)象。
(二)基因CTHRC1生物學(xué)功能的初步探討
1.基因CTHRC1對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞生物功能的影響
1.1 Western Blot檢測(cè)SW480, SW620, HC
13、T116, LS174, HT29,和LOVO這6種人結(jié)直腸癌細(xì)胞株中CTHRC1的蛋白表達(dá)含量。以GAPDH為內(nèi)參照物,將Western Blot的結(jié)果照片用Gelpro32軟件進(jìn)行分析,以條帶的光密度值(IOD)作為對(duì)應(yīng)條帶的表達(dá)量。將目的條帶和內(nèi)參照的光密度值比較出來(lái)的倍數(shù)值用單因素方差分析進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。結(jié)果顯示在這6組細(xì)胞中CTHRC1蛋白表達(dá)量差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)。最高的是HCT116,9.2127±0.486,最
14、低的是SW480,1.455±0.21。因?yàn)镾W480(1.455±0.21)和SW620(5.224±0.053)具有相似的遺傳背景而且轉(zhuǎn)移潛能不相同,選這兩株細(xì)胞作為作為下一步試驗(yàn)的細(xì)胞。
1.2 免疫印跡檢測(cè)CTHRC1轉(zhuǎn)染效率將GV287空載體(對(duì)照組,NC)和GV287-CTHRC1重組載體分別轉(zhuǎn)染SW480,SW620細(xì)胞,Western Blot檢測(cè)發(fā)現(xiàn)穩(wěn)定轉(zhuǎn)染CTHRC1基因后的SW480,SW620細(xì)胞中
15、CTHRC1的蛋白表達(dá)較對(duì)照組升高。
1.3 CTHRC1對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞生物學(xué)特性的影響
1.3.1 CCK-8法觀察在過(guò)表達(dá)CTHRC1之后細(xì)胞增殖速度明顯下降:SW480細(xì)胞CTHRC1過(guò)表達(dá)組和對(duì)照組細(xì)胞增殖數(shù)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異出現(xiàn)在第四天(P=0.001),增殖和時(shí)間的交互效應(yīng)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(F=16.528,P<0.001),過(guò)表達(dá)組和對(duì)照組組內(nèi)細(xì)胞增殖能力組間差異具有顯著性(P<0.001);
16、SW620過(guò)表達(dá)組和對(duì)照組的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異出現(xiàn)在第3天(P=0.004)細(xì)胞生長(zhǎng)時(shí)間水平差異具有顯著性(F=2529.379,P<0.001),增殖和時(shí)間的交互效應(yīng)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(F=26.086,P<0.001),過(guò)表達(dá)組和對(duì)照組組內(nèi)細(xì)胞增殖能力組間差異具有顯著性(P<0.001)
1.3.2 克隆形成實(shí)驗(yàn)顯示:在過(guò)表達(dá)CTHRC1之后細(xì)胞平均克隆形成率下降,SW480細(xì)胞組間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001);SW620
17、細(xì)胞組間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.001)。
1.3.3 細(xì)胞體外侵襲實(shí)驗(yàn):SW480、SW620細(xì)胞CTHRC1過(guò)表達(dá)組和對(duì)照組組間遷移能力差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001; P<0.001);SW480、SW620細(xì)胞時(shí)間與細(xì)胞組間交互效應(yīng)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=69.452,P<0.001;F=117.365,P<0.001)。兩組細(xì)胞間同一天測(cè)得數(shù)據(jù)經(jīng)單因素方差分析SW480、SW620均在第二天開(kāi)始有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異
18、(P<0.001,P<0.001)。
1.3.4 劃痕試驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移能力:SW480細(xì)胞CTHRC1過(guò)表達(dá)組劃痕愈合能力強(qiáng)于對(duì)照組(P=0.041)。
2.基因CTHRC1在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)及臨床意義
2.1 收集2003年1月~2009年6月間廣州南方醫(yī)院普外科行手術(shù)治療的結(jié)直腸腺癌伴腹膜轉(zhuǎn)移病人的組織蠟塊,腫瘤原發(fā)組織蠟塊標(biāo)本57塊,腹膜轉(zhuǎn)移組織蠟塊標(biāo)本30塊,另外從數(shù)據(jù)庫(kù)中選取5年隨
19、訪期內(nèi)無(wú)腹膜轉(zhuǎn)移發(fā)生的病人原發(fā)腫瘤蠟塊標(biāo)本54塊,作為對(duì)照組。免疫組化方法驗(yàn)證CTHRC1在結(jié)直腸癌蠟塊組織中的表達(dá),用平均光密度值代表CTHRC1蛋白表達(dá)強(qiáng)度。
2.2 CTHRC1主要在胞漿內(nèi)表達(dá),伴有腹膜轉(zhuǎn)移的原發(fā)癌組、腹膜轉(zhuǎn)移組和不伴有腹膜轉(zhuǎn)移的原發(fā)組組蛋白表達(dá)量分別是0.25±0.04,0.26±0.04和0.19±0.03,組間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001),而且伴有腹膜轉(zhuǎn)移的原發(fā)癌組、腹膜轉(zhuǎn)移組的蛋白表
20、達(dá)量均高于不伴有腹膜轉(zhuǎn)移的原發(fā)組(both P<0.001)。
2.3 根據(jù)CTHRC1表達(dá)的平均值0.224,我們將所有納入課題的患者分為CTHRC1高表達(dá)組和低表達(dá)組。高表達(dá)組患者的生存時(shí)間為31.36±5.63個(gè)月,而低表達(dá)組的生存時(shí)間為57.84±3.69個(gè)月,兩組的生存時(shí)間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)。
2.4 Cox回歸分析顯示同性別、腫瘤浸潤(rùn)深度、腫瘤大小和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移一樣,CTHRC1的
21、表達(dá)水平也是一個(gè)影響患者生存獨(dú)立因素,而且CTHRC1高表達(dá)組死亡的風(fēng)險(xiǎn)是低表達(dá)組的2.754倍(P<0.001,95%CI1.731 to4.383)。
(三)基因CTHRC1與hsa-mir-520d關(guān)系的初步探討
1.CTHRC1與hsa-mir-520d靶向關(guān)系的初步預(yù)測(cè)。
1.1 以CTHRC1為檢索詞在miRDB、miRanda、miRWalk、TargetScan四個(gè)預(yù)測(cè)網(wǎng)站發(fā)現(xiàn)共
22、同交集hsa-mir-520d。并預(yù)測(cè)出hsa-mir-520d與CTHRC13'UTR區(qū)有結(jié)合位點(diǎn)。
1.2 RT-PCR法檢測(cè)Mir-520D-5P在四種不同結(jié)直腸癌細(xì)胞株中的表達(dá)。其中SW480細(xì)胞的表達(dá)量最高178.493±7.867,SW620為7.09±2.73,P<0.001,與CTHRC1蛋白表達(dá)水平呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。
2.CTHRC1與mir-520D-5P相關(guān)性分析
2.1 RT
23、-PCR法檢測(cè)23對(duì)結(jié)直腸癌配對(duì)組織中mir-520d-5P表達(dá)情況。結(jié)果顯示癌旁、正常組織中mir-520D-5P的表達(dá)量明顯高于配對(duì)癌組織中mir-520d-5P的表達(dá),且差異存在顯著性(P=0.001)
2.2 Western blot檢測(cè)23對(duì)結(jié)直腸癌配對(duì)組織中CTHRC1蛋白水平表達(dá)情況Western blot檢測(cè)23對(duì)結(jié)直腸癌組織中CTHRC1的蛋白表達(dá)水平,用Geopro32軟件對(duì)Western blot結(jié)果
24、圖片進(jìn)行分析,用灰度值代表蛋白表達(dá)的數(shù)值,GAPDH為內(nèi)參照。用CTHRC1的灰度值比GAPDH的灰度值代表蛋白表達(dá)的強(qiáng)弱,用配對(duì)樣本t檢驗(yàn)檢測(cè)可知,癌組織中CTHRC1的表達(dá)量明顯高于配對(duì)的正常組織中CTHRC1的表達(dá),數(shù)值分別是1.3018±1.016,0.6567±0.552且差異存在具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.003)。由以上結(jié)果可推測(cè)在組織水平上CTHRC1與mir-520D-5P是負(fù)相關(guān)的關(guān)系。
2.3 miR-5
25、20d-5p對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞中CTHRC1蛋白表達(dá)水平變化的影響2.3.1結(jié)直腸癌細(xì)胞SW480瞬時(shí)轉(zhuǎn)染mimics和inhibitor后,miR-520D-5P在細(xì)胞水平上的變化miRNA mimics是模擬生物體內(nèi)源的miRNAs,運(yùn)用化學(xué)合成的方法合成,能增強(qiáng)內(nèi)源性miRNA的功能。而miRNA inhibitor是化學(xué)修飾的專(zhuān)門(mén)針對(duì)細(xì)胞中特異的靶miRNA的抑制劑。SW480細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染mimics和inhibitor24h后檢測(cè)
26、發(fā)現(xiàn),mimics組miR-520D-5P的表達(dá)量為161.167±16.06而對(duì)應(yīng)的NC組為19.456±3.53,兩組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)。而inhibitor組比對(duì)應(yīng)NC組正相反,NC組miR-520D-5P的表達(dá)量要高于inhibitor組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.002)2.3.2結(jié)直腸癌細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染后CTHRC1蛋白水平表達(dá)變化轉(zhuǎn)染SW480細(xì)胞48h以后檢測(cè)CTHRC1蛋白表達(dá)變化發(fā)現(xiàn),miR-520D
27、-5Pmimics發(fā)揮了模擬生物體內(nèi)源性miRNA的作用,使CTHRC1蛋白表達(dá)下調(diào),而inhibitor則發(fā)揮了沉默miR-520d-5p的作用,使CTHRC1蛋白表達(dá)上升。
結(jié)論:
1.基因CTHRC1是結(jié)直腸癌腹膜轉(zhuǎn)移相關(guān)基因。
2.基因CTHRC1的高表達(dá)與腹膜轉(zhuǎn)移有關(guān)而且預(yù)示患者預(yù)后不佳。
3.基因CTHRC1能抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖卻又可以促進(jìn)癌細(xì)胞的遷移。
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