BCDO2基因變異調(diào)控肉雞膚色的遺傳機(jī)理研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、肉雞生產(chǎn)是重要的國民經(jīng)濟(jì)產(chǎn)業(yè),也是我國畜牧業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)。研究肉雞遺傳育種具有重要意義。隨著生活水平的提高,黃皮膚和黑皮膚等膚色的肉雞越來越受到不同消費(fèi)群體的偏愛。家雞的深色皮膚是由沉積于皮膚的黑色素細(xì)胞造成的,黑色素能夠由家雞自身通過復(fù)雜的過程合成。家雞淺膚色的形成決定于類胡蘿卜素在皮膚上的沉積量。因?yàn)榧译u不能自身合成類胡蘿卜素,因此類胡蘿卜素的沉積與家雞體內(nèi)能分解類胡蘿卜素的酶(BCMO1和BCDO2)有關(guān)。前者是機(jī)體合成維生素的關(guān)鍵

2、酶,后者與此過程雖無直接關(guān)聯(lián),但卻能非對稱裂解類胡蘿卜素使之變成無色產(chǎn)物,進(jìn)而導(dǎo)致皮膚內(nèi)類胡蘿卜素沉積量減少,形成白皮膚。本研究在前人的研究基礎(chǔ)上進(jìn)行了更深入的拓展。
  雞的BCDO2基因位于24號染色體上。已有研究表明存在三個關(guān)鍵SNPs與黃皮膚形成有關(guān),SNPA(6,264,085處G突變?yōu)锳位點(diǎn))、SNPB(6,273,428處A突變?yōu)镚)和SNPC(6,287,900處G突變?yōu)锳)。本研究以部分山東省地方雞種為樣品,通過

3、擴(kuò)增獲得了該基因的片段,并通過測序技術(shù)得到擴(kuò)增片段的詳細(xì)信息,進(jìn)而找出了更多的SNPs位點(diǎn),同時也將不同的基因型與家雞脛部皮膚顏色的黃度值(b*值)進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。另外,本研究探討了BCDO2基因在家雞不同組織中的差異表達(dá)狀況。最后,本研究又從表觀遺傳學(xué)的角度簡單了解了一下不同組織中該基因上游啟動子區(qū)甲基化程度和基因表達(dá)量的關(guān)系。
  試驗(yàn)結(jié)果如下。除已報道的經(jīng)典SNPs外,本研究又找到了17個SNPs位點(diǎn)。通過與脛色黃度值關(guān)聯(lián)分

4、析發(fā)現(xiàn)SNPA和SNPB以及另外8個位點(diǎn)與脛色黃度值顯著相關(guān),SNPC與脛色黃度值相關(guān)性不顯著。21個SNPs中,4個位于第二內(nèi)含子上,14個位于第九內(nèi)含子上,2個位于第十外顯子上。呈低度多態(tài)性的共9個,呈中度多態(tài)性的共12個。共有6個位點(diǎn)處于哈代溫伯格平衡,其余均極顯著地偏離平衡。連鎖平衡分析顯示第14個SNPs位點(diǎn)與第17個SNPs位點(diǎn)間有極強(qiáng)烈的連鎖不平衡。通過對SNPB處雜合子個體的組織差異化表達(dá)研究結(jié)果顯示:BCDO2基因在脛

5、部皮膚中表達(dá)量顯著高于背部皮膚、肌肉組織、肝臟組織和卵巢組織。對不同組織中BCDO2基因上游啟動子區(qū)域進(jìn)行甲基化檢測,發(fā)現(xiàn)隨著啟動子區(qū)甲基化程度的增加,基因表達(dá)量降低。說明了BCDO2基因在不同組織中的差異表達(dá)狀況可能與不同組織基因組中啟動子區(qū)的差異甲基化程度有關(guān)。
  深入研究BCDO2基因的遺傳機(jī)理有著重要意義。一方面能為現(xiàn)代家禽育種工作中培育具有能夠穩(wěn)定遺傳的黃皮膚性狀的品種提供指導(dǎo)意義,另一方面能為揭示物種進(jìn)化的奧秘提供思

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