中國漢族人群IGHMBP2基因多態(tài)性與IgA腎病相關(guān)關(guān)系的研究和遺傳因素在其他腎臟病中的研究.pdf

1、中山大學博士學位論文中國漢族人群IGHMBP2基因多態(tài)性與IgA腎病相關(guān)關(guān)系的研究和遺傳因素在其他腎臟病中的研究姓名：張俊申請學位級別：博士專業(yè)：內(nèi)科腎臟病學指導(dǎo)教師：婁探奇20090529中文摘要的失活將使腎小管中的原始細胞分化失去控制，從而導(dǎo)致了多囊性腎病。本論文第二部分內(nèi)容是初步研究Fat4基因和ADPKD的關(guān)系，在兩例ADPKD病人中對Fat4基因進行突變篩查，以鑒定可能的致病位點，并在正常對照組中對這些可疑SNP位點進行驗證。

2、第一部分、中國漢族人群IGHMBP2基因多態(tài)性與IgA腎病相關(guān)關(guān)系的研究1中國漢族人群IGHMBP2基因的結(jié)構(gòu)特點及SNPs的鑒定【目的】通過HapMap數(shù)據(jù)庫將中國漢族正常人群和日本人群基因結(jié)構(gòu)特點進行對比；對該基因進行SNPs篩查，初步篩選出用于進一步相關(guān)分析的多態(tài)位點?！痉椒ā渴紫葟腍apMap數(shù)據(jù)庫中提取SNP信息，構(gòu)建單倍型和域；然后我們對45例正常人群及70例lea腎病病人，G腳P2基因外顯子、外顯子一內(nèi)含子交界區(qū)200bp

3、及5’端和3’端UTR區(qū)，并包括了第一外顯子上游及最后一個外顯子下游各lKb區(qū)域進行直接測序篩查SNPs，在45例正常人群中分別用M剮眨001及MAF之_005的SNPs構(gòu)建單倍型及單倍型域，篩選出用于進一步相關(guān)分析的多態(tài)位點?！窘Y(jié)果】HapMap數(shù)據(jù)庫的分析結(jié)果顯示，中國漢族人群和日本人群的基因結(jié)構(gòu)明顯不同。通過SNP篩查，我們鑒定了37個SNPs，少見型等位基因頻率(MAF)在001至U048之間，其中1ISNPs位于基因的編碼區(qū)，

4、3個SNPs僅在正常組中有發(fā)現(xiàn)，ISNP僅在病人中有發(fā)現(xiàn)。當選取MAF≥5％的SNPs構(gòu)建單倍型和域時，一共有22個SNPs的組成了2個單倍型域：Blockl是主要的單倍型域，覆蓋了從5’上游區(qū)到3’非翻譯區(qū)369kb的基因區(qū)域，包含了20個SNPs，構(gòu)成23種單倍型；block2是一個在3’末端小的單倍型域，由2個相鄰的SNPs構(gòu)成，組成了2種單倍型；Blockl中標簽SNPs有14個，其中位于外顯子及外顯子一內(nèi)含子交界區(qū)100bp內(nèi)

5、的標簽SNP位點有6個；block2中的標簽SNP有一個。當選擇MAF≥1％的SNPs構(gòu)建單倍型和域時，由36個SNPs組成了4種單倍型域：第一個block包含19種單倍型，第二個block包含了5種單倍型，第3個包含了13種單倍型，第4個Block包含了2種單倍型；共有24個tSNPs?！窘Y(jié)論】中國漢族人群IGHMBP2基因結(jié)構(gòu)復(fù)雜，和日本人群基因結(jié)構(gòu)有較大差異。本研究結(jié)果將為進一步以該基因為候選基因進行關(guān)聯(lián)分析奠定基礎(chǔ)。2IGHMB