基于ChIP-Seq數(shù)據(jù)分析前列腺癌中雄激素受體相關基因.pdf

1、碩士學位論文論文題目基于ChIPSeq數(shù)據(jù)分析前列腺癌中雄激素受體相關基因研究生姓名荊鑫華指導教師姓名沈百榮專業(yè)名稱系統(tǒng)生物學研究方向組學數(shù)據(jù)整合、分析和軟件論文提交日期2013年4月基于ChIPSeq數(shù)據(jù)分析前列腺癌中雄激素受體相關基因摘要中文摘要I基于ChIPSeq數(shù)據(jù)分析前列腺癌中雄激素受體相關基因中文摘要雄激素受體（AR）是屬于核受體超家族中一種非常重要的類固醇受體。在細胞內(nèi)AR的主要功能是作為轉錄因子與DNA結合調(diào)控基因表達。

2、雖然雄激素受體在前列腺癌治療中扮演重要角色，但是它的作用機制還不是很清楚。本文利用前列腺癌相關的ChIPSeq數(shù)據(jù)，對雄激素受體在基因組上的結合位點做了生物信息學的注釋和分析，以期找到在前列腺癌中AR相關的生物調(diào)控通路。對來自于三種前列腺癌細胞系的6組數(shù)據(jù)的分析發(fā)現(xiàn)，AR在基因組上的結合區(qū)大部分落在內(nèi)含子上，平均比例約為83.46%而其它的16.54%則分別落在啟動子，增強子，外顯子，3’UTR區(qū)，5’UTR區(qū)，轉錄起始位點下游區(qū)和基因

3、間區(qū)。查找AR結合的啟動子序列發(fā)現(xiàn)了4條新的AR結合序列的motif。對AR調(diào)控的基因功能富集分析得到了21個GeneOntology條目，1條KEGG通路和26條GeneGo通路。分別對基因和富集通路之間的重復性分析驗證了不同數(shù)據(jù)集的分子特征在系統(tǒng)水平上的相似性高于基因水平上的相似性。對26條GeneGo通路的文獻報道驗證發(fā)現(xiàn)其中5條被之前的研究報道過，其它的21條為新通路，并通過前列腺癌相關的基因表達數(shù)據(jù)和micrNA數(shù)據(jù)驗證了它們