與先天性心臟傳導阻滯(CHB)相關小分子藥物靶點的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、先天性心臟傳導阻滯(CHB)是一種完全性房室傳導阻滯,這種疾病嚴重危害胎兒健康。據估計會影響到1/5,500的孕婦(50%胎兒死亡率)和1/11,000的新生兒,并導致患兒終身需要靠心臟起搏器生活。研究該病相關藥物靶點能夠加快該病相關藥物的研發(fā)速度、極大的推動CHB的靶向治療,同時更好的闡明該病病理。
  本文構建了與先天性心臟傳導阻滯直接相關的陽性集和該病的候選陰性集,兩個集合都由基因和蛋白相關信息構成。首先,通過網絡數據平臺利

2、用文本挖掘就目前研究較多可信度高的該病相關蛋白進行了信息整合,構建了該病相關的陽性集。其次,利用PubMed、OMIM查找該病與房室心律失常、心臟衰竭間存在的疾病關聯(lián),將通過疾病間關聯(lián)分析研究復雜疾病的報道為理論依據,在DrugBank數據庫中間接尋找該病相關潛在藥物靶點,構建了該病的候選陰性集。
  通過兩個集合間基因語義相似性計算比較,以及ENDEAVOUR數據庫數據注釋達到了優(yōu)化該病相關潛在藥靶蛋白的目的。結果,預測了20個

3、潛在藥物靶點。隨后,使用GENECODIS對預測出的20個潛在藥物靶點的藥靶蛋白及相應基因做了GO功能、相關通路和MicroRNA、SNP的富集分析。本文通過研究發(fā)現(xiàn)20個潛在藥物靶點的功能較多集中在門控離子通道活性、轉運活性、信號傳導活性、離子轉運活性和離子通道活性;候選陰性集中基因富集到最多的一條通路是(KEGG)04020的鈣信號傳導通路,與之前類似研究結果相符。其次,還找到富集效果較好之前未有報道的(KEGG)04010的MAP

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