‘南通小方柿’GA2ox基因的克隆與功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、‘南通小方柿’(Diospyros kaki Linn.cv.Nantongxiaofangshi)是1982年在江蘇省進(jìn)行果樹資源普查時于南通市發(fā)現(xiàn)的珍稀矮生型柿樹品種。該品種干性弱,無明顯中心干,樹姿開張,表現(xiàn)出明顯的矮生性狀;成年樹高僅3.5-4米,為同等條件下生長的喬化品種的60%。本實驗擬對‘南通小方柿’中GA2ox基因進(jìn)行克隆及生物信息學(xué)分析,在不同物候期的表達(dá)進(jìn)行研究,并在轉(zhuǎn)化煙草中的異位表達(dá)進(jìn)行了功能驗證。主要研究結(jié)果如

2、下:
  1.以‘南通小方柿’幼嫩葉片為材料,通過改良的CTAB法提取總RNA,利用簡并引物同源克隆出GA2ox家族中兩個基因的片段,采用RACE方法得到基因的全長cDNA序列,分別命名為DkGA2ox1和DkGA2ox2。兩基因的核苷酸序列與毛白楊(JX102472.1)、夾竹桃(AY594292.1)、煙草(AB125232.1)、矮牽牛(GU059939.1)蘋果(FJ571521.1)、梨(JF441168.1)、葡萄(J

3、Q608472.1)的相似度達(dá)73%~77%。含有保守20G-Fe(Ⅱ)-Oxy蛋白結(jié)構(gòu)域,高度保守的與2-酮戊二酸結(jié)合位點(DkGA2ox1:Arg-272、Ser-274; DkGA2ox2: Arg-271、Ser-273)和Fe2+結(jié)合位點(DkGA2ox1:His-205、Asp-207、His-262; DkGA2ox2: His-204、Asp-206、His-261),有著赤霉素2-氧化酶蛋白家族共同的結(jié)構(gòu)特點。生物信息

4、學(xué)分析DkGA2ox1和DkGA2ox2全長cDNA序列為1318bp和1267bp,分別含有一個198bp和61bp的5'非翻譯區(qū),及97bp和172bp的3'非翻譯區(qū)。編碼區(qū)編碼332個和334個氨基酸。編碼蛋白分子量分別為36596.1Da、37544.2Da,均為穩(wěn)定蛋白,無信號肽,無跨膜結(jié)構(gòu)域,無明顯疏水區(qū)。基因家族分析顯示DkGA2ox1和DkGA2ox2屬于C19-GA2oxs家族。
  2.瞬時表達(dá)載體的構(gòu)建及洋蔥

5、表皮細(xì)胞轉(zhuǎn)化后,洋蔥表皮細(xì)胞的綠色熒光蛋白GFP瞬時表達(dá)結(jié)果顯示,DkGA2ox1編碼蛋白定位于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中。熒光定量RT-PCR結(jié)果顯示DkGA2ox1和DkGA2ox2在7個典型物候期中均有表達(dá)并均高于同時期的喬化品種‘大方柿’,其中在開花期表達(dá)量最高。表明南通小方柿中赤霉素2-氧化酶基因的表達(dá)與矮生性狀相關(guān)。
  3.構(gòu)建了‘南通小方柿’DkGA2ox1和DkGA2ox2基因的植物雙元表達(dá)載體,通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將其轉(zhuǎn)化煙

6、草。經(jīng)GUS染色鑒定,PCR和RT-PCR對抗Hyp株系進(jìn)行檢測,獲得2個轉(zhuǎn)DkGA2ox1株系和2個轉(zhuǎn)DkGA2ox1株系。形態(tài)學(xué)鑒定表明,轉(zhuǎn)基因株系株高均與對照有極顯著差異,轉(zhuǎn)DkGA2ox1基因株系1-1、1-3的株高分別為對照的59.31%和41.54%。轉(zhuǎn)DkGA2ox2基因株系2-1、2-4的株高僅為對照植株的63.52%和32.11%。另外,轉(zhuǎn)基因株系節(jié)間距離縮短,為野生型煙草的32.23%~86.78%;莖粗增粗,比野生

7、型煙草增粗11.91%~64.99%;葉片長度縮短,為野生型煙草的52.94%~76.74%;葉片寬度增大,比野生型煙草增大4.37%~30.16%; GA1+3含量下降:轉(zhuǎn)基因株系1-1、2-1的赤霉素含量僅為對照的65%~70%;轉(zhuǎn)基因株系1-3、2-4的赤霉素含量為對照41%~45%;轉(zhuǎn)基因株系凈同化效率比對照上升了11.3%~33.5%,并且更為矮化的1-4、2-3均比轉(zhuǎn)同一基因的另一株系高。蒸騰速率與氣孔導(dǎo)度呈正相關(guān),轉(zhuǎn)基因株

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