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1、核酸及其單核苷酸多態(tài)性(SNP)的分析檢測(cè)在當(dāng)前生化研究和臨床診斷等領(lǐng)域具有重要的意義。開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)便、快速、高靈敏和特異性好的均相無(wú)標(biāo)記的核酸和SNP的檢測(cè)新方法具有廣泛的應(yīng)用前景。論文主要應(yīng)用滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)和納米粒子探針技術(shù),結(jié)合生物發(fā)光、分子熒光和共振光散射等檢測(cè)技術(shù)研究開(kāi)發(fā)了系列均相無(wú)標(biāo)記檢測(cè)核酸和SNP的新方法,主要內(nèi)容如下:
1、結(jié)合簡(jiǎn)便、高效的滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)和高靈敏的熒光蟲(chóng)素生物發(fā)光反應(yīng),建立了均相無(wú)標(biāo)記檢測(cè)SN
2、P的新方法。方法基于突變型DNA可特異的引發(fā)滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng),應(yīng)用螢火蟲(chóng)素生物發(fā)光反應(yīng)檢測(cè)滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)中產(chǎn)生的大量焦磷酸根。相對(duì)照,野生型DNA不能引發(fā)RCA反應(yīng),根據(jù)二者生物發(fā)光信號(hào)的顯著差異,可實(shí)現(xiàn)突變型DNA的高靈敏度檢測(cè)和特異地區(qū)分單堿基差別,方法對(duì)突變型DNA的定量檢出限為0.45 pmol/L,可精確測(cè)定1%突變頻率。
2、基于滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)的原理,在滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)過(guò)程中,加入與滾環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物互補(bǔ)的反向引物,該引物以滾環(huán)
3、擴(kuò)增產(chǎn)物為模板引發(fā)反向頂替支化擴(kuò)增,產(chǎn)生大量的單鏈和雙鏈的DNA產(chǎn)物,利用特異性的DNA檢測(cè)熒光染料SYBR Green I進(jìn)行熒光檢測(cè),建立了滾環(huán)擴(kuò)增均相無(wú)標(biāo)記熒光法檢測(cè)SNP的新方法。根據(jù)突變型和野生型DNA產(chǎn)生的熒光信號(hào)差異,實(shí)現(xiàn)了1%突變頻率的特異性檢測(cè)和高靈敏的定量檢測(cè)突變型DNA,檢出限為8.6 fmol/L。
3、應(yīng)用滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)均相無(wú)標(biāo)記檢測(cè)微小RNA(miRNA)。方法以miRNA為模板使掛鎖探針特異性的
4、連接成環(huán);然后以環(huán)形DNA探針為模板,miRNA直接作為引物引發(fā)滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng),同時(shí)加入與RCA反應(yīng)產(chǎn)物互補(bǔ)的反向引物,引發(fā)支化擴(kuò)增,結(jié)果產(chǎn)生大量多種長(zhǎng)度的單鏈和雙鏈的DNA產(chǎn)物,應(yīng)用特異性的DNA檢測(cè)熒光染料進(jìn)行定量。方法無(wú)需反轉(zhuǎn)錄步驟,操作簡(jiǎn)便、靈敏度高、可特異性地檢測(cè)單堿基差別的miRNAs。
4、制備了穩(wěn)定性好、便宜和生物兼容性好的氫氧化鐵納米粒子,通過(guò)靜電力作用,鐵納米粒子以DNA分子為模板進(jìn)行組裝聚集,應(yīng)用高靈敏
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