GWAS篩選的基因多態(tài)性與幽門螺旋桿菌在胃癌易感性中的交互作用研究.pdf

1、背景和目的:近期發(fā)表的三項全基因組關聯(lián)研究(GWAS)報道了新發(fā)現(xiàn)的中國人群中胃癌易感性的基因多態(tài)性,其中三個單核苷酸多態(tài)性(SNP)(分別為rs4072037,rs13361707和rs2274223)是位于與宿主炎癥反應相關的基因上。而幽門螺旋桿菌(HP)也是通過引起宿主炎癥反應引發(fā)胃癌的重要因素。因此,本研究將探索這三個SNP位點與幽門螺旋桿菌感染對胃癌的發(fā)生是否存在基因-環(huán)境的交互作用,從而進一步揭示胃癌發(fā)生的高危因素。

2、　　方法:共有來自于同濟醫(yī)院335例胃腺癌病人和334例正常對照人入組。用Taqman探針法對GWAS中三個SNP位點(分別為rs4072037,rs13361707,rs2274223)進行基因型檢測。用酶聯(lián)免疫吸附劑測定(ELISA)方法檢測幽門螺旋桿菌的血清學反應。應用SPSS17.0軟件用多因素logistic回歸方法分析每個變量與胃癌發(fā)病風險之間的關系以及基因-環(huán)境交互作用分析,計算優(yōu)勢比(oddsratio,OR)值及95％

3、可信區(qū)間(95%confidenceinterval,95%CI)等.
　　結果:多因素Logistic回歸分析調整性別、年齡、體重指數(shù)(BMI)、吸煙、飲酒和HP感染因素后,應用顯性模型分析GWAS中三個SNP位點的變異性基因型與胃癌發(fā)病風險結果:rs4072037(AG+GG)發(fā)生胃癌的風險為OR=0.50,95%CI為0.35-0.72;rs13361707(CT+CC)發(fā)生胃癌的風險為OR=1.63,95%CI為1.14-

4、2.33;rs2274223(AG+GG)發(fā)生胃癌的風險為OR=1.33,95%CI為0.96-1.83。多因素Logistic回歸分析調整性別、年齡、體重指數(shù)、吸煙和飲酒因素后,幽門螺旋桿菌感染也顯著性增加了胃癌易感性(OR=1.74,95%CI為1.27-2.38)。進一步探討基因與HP感染的交互作用,相較于HP血清學陰性且攜帶非危險基因型的人群,HP血清學陽性且攜帶危險基因型的人群發(fā)生胃癌的危險性最高。調整性別、年齡、BMI、吸煙

5、和飲酒因素后,相較于HP陰性且rs4072037AG/GG基因型人群,HP陽性且rs4072037AA基因型人群發(fā)生胃癌的OR為3.96,95%CI,2.30-6.81;相對于HP陰性且rs13361707TT基因型人群,HP陽性且rs13361707CT/CC基因型人群發(fā)生胃癌的OR為2.65,95%CI,1.60-4.37;相對于HP陰性且rs2274223AA基因型人群,HP陽性且rs2274223AG/GG基因型人群發(fā)生胃癌的O