肺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白(LCMR1)相互作用蛋白的初步篩選.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:肺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白1(LCMR1)的編碼基因是實驗室采用mRNA差異顯示技術(shù)克隆到的新基因(AY148462),目前功能不明確,為了研究該基因的功能,采用酵母雙雜交系統(tǒng)從預(yù)轉(zhuǎn)化人肝文庫篩選LCMR1的相互作用蛋白,為進一步研究該基因的功能提供線索。 方法:(1)PCR擴增pGEX-5T-LCMR1載體中的LCMR1編碼區(qū)序列,通過引入EcoRI和PstI內(nèi)切酶位點,將LCMR1編碼區(qū)克隆到酵母雙雜交系統(tǒng)中的pGBKT7載體,

2、得到誘餌質(zhì)粒pGBKT7-LCMR1,轉(zhuǎn)化酵母菌AH109后,檢測BD-LMCR1融合蛋白的表達、LCMR1蛋白的轉(zhuǎn)錄激活活性及對宿主菌AH109的毒性;(2)轉(zhuǎn)化了誘餌質(zhì)粒pGBKT7-LCMR1的酵母菌AH109與轉(zhuǎn)化了人肝文庫質(zhì)粒的酵母菌Y187進行交配培養(yǎng),利用營養(yǎng)缺陷型培養(yǎng)基,初步篩選陽性克?。?3)重復(fù)檢測報告基因的表達和去除陽性克隆中多余的質(zhì)粒;(4)提取陽性克隆中的質(zhì)粒DNA,用PCR和酶切的方法減少重復(fù)克隆,然后轉(zhuǎn)化大

3、腸桿菌DH5α,利用含氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基篩選AD文庫質(zhì)粒轉(zhuǎn)化子,提取AD文庫質(zhì)粒;(5)將pGBKT7-LCMR1質(zhì)粒和AD文庫質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化酵母菌AH109,轉(zhuǎn)化混合物鋪板于營養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基,再次驗證其相互作用;(6)陽性克隆中AD文庫質(zhì)粒測序及生物信息學(xué)分析。 結(jié)果:(1)PCR和測序鑒定pGBKT7-LCMR1載體構(gòu)建成功,轉(zhuǎn)化AH109,BD-LCMR1融合蛋白成功表達,LCMR1蛋白無轉(zhuǎn)錄激活活性和宿主毒性;(2)通過文

4、庫篩選得到72個陽性克??;(3)經(jīng)報告基因激活檢測、多余質(zhì)粒去除剩余57個克隆;(4)經(jīng)酶切歸類獲得30陽性克??;(5)共轉(zhuǎn)化再次驗證相互作用后仍為陽性的克隆有14個,經(jīng)測序和信息學(xué)分析,其中非編碼序列7個,編碼序列7個,這7個編碼序列分別是RPL29、RPS15a、HAMP、補體C3、ND4L、ND1和細(xì)胞色素P450。 結(jié)論:(1)成功構(gòu)建酵母雙雜交系統(tǒng)所需的無轉(zhuǎn)錄激活活性、且對酵母菌無毒性的誘餌質(zhì)粒PGBKT7-LCMR1

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