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1、目的:肺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白1(LCMR1)的編碼基因是實(shí)驗(yàn)室采用mRNA差異顯示技術(shù)克隆到的新基因(AY148462),目前功能不明確,為了研究該基因的功能,采用酵母雙雜交系統(tǒng)從預(yù)轉(zhuǎn)化人肝文庫(kù)篩選LCMR1的相互作用蛋白,為進(jìn)一步研究該基因的功能提供線索。 方法:(1)PCR擴(kuò)增pGEX-5T-LCMR1載體中的LCMR1編碼區(qū)序列,通過(guò)引入EcoRI和PstI內(nèi)切酶位點(diǎn),將LCMR1編碼區(qū)克隆到酵母雙雜交系統(tǒng)中的pGBKT7載體,
2、得到誘餌質(zhì)粒pGBKT7-LCMR1,轉(zhuǎn)化酵母菌AH109后,檢測(cè)BD-LMCR1融合蛋白的表達(dá)、LCMR1蛋白的轉(zhuǎn)錄激活活性及對(duì)宿主菌AH109的毒性;(2)轉(zhuǎn)化了誘餌質(zhì)粒pGBKT7-LCMR1的酵母菌AH109與轉(zhuǎn)化了人肝文庫(kù)質(zhì)粒的酵母菌Y187進(jìn)行交配培養(yǎng),利用營(yíng)養(yǎng)缺陷型培養(yǎng)基,初步篩選陽(yáng)性克?。?3)重復(fù)檢測(cè)報(bào)告基因的表達(dá)和去除陽(yáng)性克隆中多余的質(zhì)粒;(4)提取陽(yáng)性克隆中的質(zhì)粒DNA,用PCR和酶切的方法減少重復(fù)克隆,然后轉(zhuǎn)化大
3、腸桿菌DH5α,利用含氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基篩選AD文庫(kù)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化子,提取AD文庫(kù)質(zhì)粒;(5)將pGBKT7-LCMR1質(zhì)粒和AD文庫(kù)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化酵母菌AH109,轉(zhuǎn)化混合物鋪板于營(yíng)養(yǎng)缺陷培養(yǎng)基,再次驗(yàn)證其相互作用;(6)陽(yáng)性克隆中AD文庫(kù)質(zhì)粒測(cè)序及生物信息學(xué)分析。 結(jié)果:(1)PCR和測(cè)序鑒定pGBKT7-LCMR1載體構(gòu)建成功,轉(zhuǎn)化AH109,BD-LCMR1融合蛋白成功表達(dá),LCMR1蛋白無(wú)轉(zhuǎn)錄激活活性和宿主毒性;(2)通過(guò)文
4、庫(kù)篩選得到72個(gè)陽(yáng)性克??;(3)經(jīng)報(bào)告基因激活檢測(cè)、多余質(zhì)粒去除剩余57個(gè)克??;(4)經(jīng)酶切歸類獲得30陽(yáng)性克??;(5)共轉(zhuǎn)化再次驗(yàn)證相互作用后仍為陽(yáng)性的克隆有14個(gè),經(jīng)測(cè)序和信息學(xué)分析,其中非編碼序列7個(gè),編碼序列7個(gè),這7個(gè)編碼序列分別是RPL29、RPS15a、HAMP、補(bǔ)體C3、ND4L、ND1和細(xì)胞色素P450。 結(jié)論:(1)成功構(gòu)建酵母雙雜交系統(tǒng)所需的無(wú)轉(zhuǎn)錄激活活性、且對(duì)酵母菌無(wú)毒性的誘餌質(zhì)粒PGBKT7-LCMR1
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