淋巴瘤寡核苷酸芯片的制備及其在淋巴瘤細(xì)胞系基因表達(dá)譜研究中的應(yīng)用.pdf

1、研究目的:該研究制備了含116條淋巴瘤相關(guān)基因的寡核苷酸芯片,并以此篩選了在Burkitt's淋巴瘤(BL)和皮膚T細(xì)胞性淋巴瘤(CTCL)細(xì)胞系細(xì)胞與正常淋巴細(xì)胞間差異表達(dá)的基因,并將對(duì)其功能進(jìn)行了初步的生物信息學(xué)分析,以期為探討淋巴瘤的發(fā)病機(jī)制、篩選和鑒定腫瘤相關(guān)基因、早期診斷和分子分型、發(fā)現(xiàn)和確定治療新途徑等方面提供一些線索和理論依據(jù).研究?jī)?nèi)容:1)淋巴瘤寡核苷酸基因表達(dá)譜芯片的制備:以熒光素酶、惡性淋巴瘤相關(guān)基因?yàn)檠芯繉?duì)象,采用

2、計(jì)算機(jī)軟件設(shè)計(jì)并經(jīng)BLAST分析篩選基因特異寡核苷酸探針,探針長(zhǎng)度40nt,GC含量45-55﹪,5'或3'氨基修飾,濃度為0.5ug/μl,質(zhì)控方法采用定量陽(yáng)性對(duì)照結(jié)合定量?jī)?nèi)標(biāo)的方法對(duì)雜交過程和檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行監(jiān)測(cè);2)淋巴瘤基因芯片在淋巴瘤細(xì)胞系基因表達(dá)譜研究中的初步應(yīng)用:用淋巴瘤寡核苷酸基因表達(dá)譜芯片對(duì)BL(Namalwa、Daudi、Raji)和CTCL(H9、Hut-78)的基因表達(dá)譜進(jìn)行了檢測(cè),并對(duì)篩選出的差異表達(dá)基因進(jìn)行初步的

3、生物信息學(xué)分析.結(jié)果:該實(shí)驗(yàn)從BL和CTCL細(xì)胞系細(xì)胞/正常淋巴細(xì)胞中成功篩選出16個(gè)差異表達(dá)的基因.在Burkitt's淋巴瘤細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)11條差異表達(dá)基因(9.48﹪):上調(diào)表達(dá)7條,下調(diào)表達(dá)4條;在皮膚T淋巴瘤細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)8條差異表達(dá)基因(6.89﹪):上調(diào)表達(dá)6條,下調(diào)表達(dá)2條.經(jīng)生物信息學(xué)初步分析,發(fā)現(xiàn)這些基因與細(xì)胞的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、周期調(diào)控及增殖、分化、凋亡調(diào)控等密切相關(guān).結(jié)論:寡核苷酸芯片是一種篩選差異表達(dá)基因的有效工具,惡性淋巴瘤