小麥Rht-Dlc位點跨疊群構(gòu)建及BAC1J9序列分析.pdf

1、山東農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文小麥RhtDlc位點跨疊群構(gòu)建及BAC1J9序列分析姓名：吳佳潔申請學位級別：碩士專業(yè)：作物遺傳育種指導教師：張春慶孔秀英20040612山東農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文摘要矮敗小麥具有來自矮變一號的優(yōu)異矮稈基因RhtDlc(Rhtl0)和來自太谷核不育小麥的顯性不育基因ms2，RhtDlc與ms2緊密連鎖于4D染色體短臂上，具有很高的經(jīng)濟價值和理論研究價值。該研究是在以矮敗中國春小麥品系中的矮稈不育株為材料，完成了BA

2、C文庫構(gòu)建的基礎(chǔ)上，利用與RhtDlc共分離的分子標記篩選BAC文庫，并對得到的陽性克隆進行測序分析，分離RhtDlc基因的候選基因，并為ms2基因的圖位克隆打下基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下：1)用等位特異性的PCR引物從矮敗中國春小麥品系BAC文庫中篩選得到16個陽性克隆，包含了三種酶切帶型，陽性BAC克隆中，插入片段最小的為110kb，最大的為200kb。2)選擇陽性克隆BAC1J9構(gòu)建亞克隆文庫，隨機挑選亞克隆并進行兩端測序。共獲得2877

3、條高質(zhì)量的序列，拼接后得到了BAC1J9的一致序列，大約198kb，序列中還有19個空隙(gap)。3)對BAC1J9的序列分析表明，接近200kb片段中，有5個基因，平均基因密度為40kb，其中三個基因集中在BAClJ9末端的一段16kb區(qū)域內(nèi)，形成密度53kb的基因密集區(qū)。73％的序列為各種類型的重復序列，其中反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子類型占83％。BAClJ9中有7個完整的反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座予，兩個Ty3gypsy類型和五個Tylcopia類型。BAC