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1、中山大學碩士學位論文SOLiD測序技術在果蠅MicrNA與轉錄本表達相關性研究中的應用姓名:楊曉玲申請學位級別:碩士專業(yè):生物化學與分子生物學指導教師:施蘇華唐恬20100605中山大學碩士學位論文SOLID測序技術在果蠅MieroRNA與轉錄奉表達相關性研究中的應用條序列,其中有58,329,773條序列可以比對到基因組,大約覆蓋果蠅轉錄組的20倍。我們對RNAseq技術進行了評價,發(fā)現(xiàn)不同Barcode之間的差異基本不會影響到基因表
2、達的比較,同時基因不同區(qū)域的平均reads數(shù)目也趨于相等。然而對于單個基因來說,reads的分布并不均勻,這可能與基因本身放入堿基組成有關。我們對不同物種,不同性別的基因表達情況進行了比較,發(fā)現(xiàn)分別有39%和27%的基因在物種和性別中表現(xiàn)出15倍以上的差異,但是miRNA靶基因在物種以及性別之間的差異相比于轉錄本總體來說卻不明顯。同時我們也發(fā)現(xiàn),靶基因中含有越多的保守位點,這種表達差異越小,而且表達穩(wěn)定性似乎與miRNA本身的表達量并沒
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