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1、第二節(jié)RNA的生物合成RNA的生物合成包括RNA轉(zhuǎn)錄(tranion)與RNA復(fù)制。除少數(shù)RNA病毒,以RNA復(fù)制的方式傳遞遺傳信息外,大部分生物中遺傳信息都是從DNA分子中以轉(zhuǎn)錄方式合成RNA而輸出的,即以DNA為模板,以四種核糖核苷酸為原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA。轉(zhuǎn)錄是基因表達(dá)的第一步,是遺傳信息傳遞的重要環(huán)節(jié)。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物有:mRNA、rRNA、tRNA、小RNA。一、轉(zhuǎn)錄體系參與RNA合成的成分有多種,包括DNA模板、四種
2、三磷酸核糖核苷(NTP)、RNA聚合酶、某些蛋白質(zhì)因子及必要的無(wú)機(jī)離子等,這些總稱為轉(zhuǎn)錄體系。(一)DNA模板轉(zhuǎn)錄以DNA為模板,根據(jù)堿基配對(duì)原則,按照DNA模板中核苷酸的排列順序合成互補(bǔ)的RNA分子。DNA分子中的A、G、C、T分別對(duì)應(yīng)于合成RNA分子中的U、C、G、A。模板DNA的序列決定著轉(zhuǎn)錄RNA的序列,從而將DNA的遺傳信息傳給RNA。與DNA復(fù)制不同,轉(zhuǎn)錄具有不對(duì)稱性。即在一個(gè)包含多個(gè)基因的雙鏈DNA分子中(如稱為A鏈及B鏈
3、),某個(gè)基因節(jié)段只以A鏈為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄,B鏈不轉(zhuǎn)錄,而在另一個(gè)基因節(jié)段可由B鏈為模板,A鏈不轉(zhuǎn)錄。在轉(zhuǎn)錄中,基因的DNA雙鏈中可以作模板的鏈稱為模板鏈,不作為模板的另一條DNA鏈稱為編碼鏈。轉(zhuǎn)錄的RNA序列與DNA模板鏈序列是互補(bǔ)的,而與DNA中編碼鏈序列基本相同(U代替了T)。(二)底物轉(zhuǎn)錄所需的底物(原料)是四種三磷酸核糖核苷(NTP),即ATP、GTP、CTP、UTP。每聚合1分子核糖核苷酸需水解掉NTP的1個(gè)磷酸鍵以提供所需能量
4、。(三)RNA聚合酶RNA聚合酶是依賴DNA的RNA聚合酶(DNAdependentRNApolymerase,DDRP)。RNA聚合酶在原核生物、真核生物、病毒及噬菌體中均普遍存在。1、原核生物RNA聚合酶以大腸桿菌(E.coli)為例,E.coli和其它原核細(xì)胞一樣,只有一種RNA聚合酶,合成各種RNA。一個(gè)E.coli細(xì)胞中約有7000個(gè)RNA聚合酶分子,在任一時(shí)刻,大部分聚合酶(5000個(gè)左右)正在參與RNA的合成,具體數(shù)量依生
5、長(zhǎng)條件而定。3、噬菌體T3和T7編碼的RNA聚合酶僅為一條分子量11000Da的多肽鏈,這些聚合酶只識(shí)別噬菌體DNA的少數(shù)啟動(dòng)子,并無(wú)選擇地與其作用,37℃時(shí)的聚合速度200堿基秒。二、轉(zhuǎn)錄過(guò)程RNA的轉(zhuǎn)錄過(guò)程可分為起始、RNA鏈的延長(zhǎng)及終止三個(gè)階段,轉(zhuǎn)錄起始前需要相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子共同作用。(一)原核生物基因轉(zhuǎn)錄的起始首先RNA聚合酶的σ因子辨認(rèn)DNA的啟動(dòng)子部位,并帶動(dòng)RNA聚合酶的全酶與啟動(dòng)子結(jié)合,形成復(fù)合物。RNA聚合酶可以“擠”入
6、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)之內(nèi),起到解旋作用,并使DNA的局部結(jié)構(gòu)松弛,解開約10幾個(gè)堿基對(duì)長(zhǎng)的DNA雙鏈形成轉(zhuǎn)錄泡,暴露出DNA模板鏈。與復(fù)制不同的是,RNA聚合酶可以開始新RNA鏈合成,因此轉(zhuǎn)錄起始不需要引物。RNA聚合酶進(jìn)入起始部位后,直接催化NTP,使其與模板鏈上相應(yīng)的堿基配對(duì)(UA,AT,GC),并結(jié)合到DNA模板鏈上,形成第一個(gè)磷酸二酯鍵。第一個(gè)核苷酸以GTP最常見,與第二個(gè)核苷酸結(jié)合后GTP仍保留5’端三個(gè)磷酸,形成RNA聚合酶全酶
7、DNApppGpNOH3’復(fù)合物,稱為轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物。RNA鏈開始合成后,σ因子從復(fù)合物上脫落,核心酶進(jìn)一步合成RNA鏈。σ因子可以反復(fù)使用,它可與新的核心酶結(jié)合成RNA聚合酶的全酶,起始另一次轉(zhuǎn)錄過(guò)程。(二)RNA鏈的延長(zhǎng)RNA鏈的延長(zhǎng)反應(yīng)由核心酶催化。核心酶沿模板DNA鏈向下游方向滑動(dòng),每滑動(dòng)一個(gè)核苷酸的距離,則有一個(gè)核糖核苷酸按DNA模板鏈的堿基互補(bǔ)關(guān)系進(jìn)入模板,即UA、AT、CG,形成一個(gè)磷酸二酯鍵,如此不斷延長(zhǎng)下去。與DNA復(fù)
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