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1、一.名詞解釋(多數(shù)為理解為主)第一章蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能1.1.蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子中氨基酸的排列順序稱蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)。一級結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵是肽鍵,有的還包含二硫鍵。一級結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。5.生物活性肽:具有生物學(xué)活性的寡肽或多肽。例如谷胱甘肽等。2.2.蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),也就是該肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈
2、的構(gòu)象。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)包括α螺旋、β折疊、β轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲。維持蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵是氫鍵3.3.蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu):由兩條或兩條以上多肽鏈組成的蛋白質(zhì),每一條多肽鏈都有其完整的三級結(jié)構(gòu),稱為蛋白質(zhì)的亞基,亞基與亞基之間呈特定的三維空間排布,并以非共價鍵相連接,這種蛋白質(zhì)分子中各個亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。4.肽單元(peptideunit):參與肽鍵的6個原子——Cα1,C,O,
3、N,H,Cα2。位于同一平面,Cα1和Cα2在平面上所處的位置為反式(trans)構(gòu)型,此同一平面上的6個原子構(gòu)成肽單元。5.鹽析:指將硫酸銨、硫酸鈉等無機鹽類加入蛋白質(zhì)溶液,破壞蛋白質(zhì)在溶液中的穩(wěn)定性因素而沉淀,各種蛋白質(zhì)鹽析時所需的鹽濃度及pH均不同。6.氨基酸的等電點:在某一pH值的溶液中,氨基酸解離成陰/陽離子的趨勢及程度相等,成為兼性離子,呈電中性,此時溶液的pH值稱該氨基酸的等電點。7.glutathine:即谷胱甘肽,
4、是由谷、半胱和甘氨酸組成的三肽,分子中半胱氨酸的巰基是其主要功能基因,具有還原性和嗜核特性,故谷胱甘肽可保護機體免遭氧化劑和毒物的損害。10.蛋白質(zhì)變性:在某些物理或化學(xué)因素的作用下,蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象被破壞,從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)的改變和生物活性的喪失,稱蛋白質(zhì)的變性。8.肽平面:參與肽鍵形成的6個原子(Cα1,C,O,N,H,Cα2)位于同一平面,Cα1和Cα2在平面上所處的位置為反式(trans)構(gòu)型,此同一平面上的6個原子構(gòu)成肽平面,
5、即肽單元(peptideunit)。9.次級鍵:指不形成共價鍵的鍵,如氫鍵、疏水(鍵)作用、范德華力等。10.結(jié)構(gòu)域:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中二級結(jié)構(gòu)與三級結(jié)構(gòu)之間的一個層次。在較大的蛋白質(zhì)分子中,由于多肽鏈相鄰時超二級結(jié)構(gòu)緊密聯(lián)系,形成二個或多個在空間上可以明顯區(qū)別的局部區(qū)域,這種局部區(qū)域稱為結(jié)構(gòu)域。結(jié)構(gòu)域與分子整體以共價鍵相連,一般難以分離,這是它與蛋白質(zhì)亞基結(jié)構(gòu)的區(qū)別,一般每個結(jié)構(gòu)域由100~200個氨基酸組成,各有獨特的空間構(gòu)象,承擔(dān)不同的
6、生物學(xué)功能。例如,免疫球蛋白有12個結(jié)構(gòu)域,補體結(jié)合部位與抗原結(jié)合部位處于不同的結(jié)構(gòu)域。11.Edman降解法:為肽鏈氨基酸測序的方法。肽段先與異硫氰酸苯酯反應(yīng),異硫氰酸苯酯只與肽段的氨基末端的氨基酸的游離α氨基作用,再用冷稀酸處理,氨基末端殘基從肽鏈上脫落下來,成為異硫氰酸苯酯的衍生物,用層析的方法可鑒定為何種氨基酸的衍生物。殘留的肽鏈可繼續(xù)與異硫氰酸苯酯作用,逐個鑒定出氨基酸的排列順序。12折疊(βpleatedsheet):是蛋白
7、質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的一種,其主要特征是:①多肽鏈充分伸展,每個肽單元以Cα為旋轉(zhuǎn)點,依次折疊成鋸齒結(jié)構(gòu);②氨基酸側(cè)鏈交替地位于鋸齒狀結(jié)構(gòu)的上、下方;③兩條以上肽鏈或一條肽鏈內(nèi)的若干肽段平行排列,通過鏈間羰基氧和亞氨基氫形成氫鍵,從而穩(wěn)固β折疊結(jié)構(gòu);④肽鏈有順式平行和反式平行兩種。第二章核酸的結(jié)構(gòu)與功能1.反密碼子:存在于tRNA的反密碼環(huán)中,可與mRNA上相應(yīng)的三聯(lián)體密碼子形成堿基互補,從而tRNA能將氨基酸攜帶至核糖體上參與蛋白質(zhì)合成。2.D
8、NA的一級結(jié)構(gòu):在多核苷酸鏈中,脫氧核糖核苷酸的排列順序,稱為DNA的一級結(jié)構(gòu)。由于脫氧核糖核苷酸的差異主要是堿基不同,因此也稱為堿基序列。3.退火:變性的DNA經(jīng)緩慢冷卻后,兩條互補鏈可重新恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象,這一現(xiàn)象稱為復(fù)性,也稱退火。4.β轉(zhuǎn)角:是蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)形式,常發(fā)生于肽鏈進行180回折時的轉(zhuǎn)角上。β轉(zhuǎn)角通常由4個氨基酸殘基組成,其第1個氨基酸殘基的羰基氧與第4個殘基的氨基氫可形成氫鍵。β轉(zhuǎn)角的結(jié)構(gòu)較特殊,第2個殘基常為
9、脯氨酸,其他常見殘基有甘氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺和色氨酸。5解鏈溫度:DNA的變性從開始解鏈到完全解鏈,是在一個相當(dāng)窄的溫度內(nèi)完成的,在這一范圍內(nèi),紫外線吸收值達到最大值50%時的溫度稱為解鏈溫度。6.DNA變性:雙鏈DNA(dsDNA)在變性因素(如過酸、過堿、加熱、尿素等)影響下,解鏈成單鏈DNA(ssDNA)的過程稱之為DNA變性。DNA變性后,生物活性喪失,但一級結(jié)構(gòu)沒有改變,所以在一定條件下仍可恢復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu)。3.枸櫞酸枸櫞酸
10、丙酮酸循環(huán)丙酮酸循環(huán):citratepyruvatecycle,乙酰(20A是合成脂肪酸的原料,主要來自葡萄糖代謝。細(xì)胞內(nèi)乙酰CoA全部在線粒體內(nèi)產(chǎn)生,而合成脂肪酸的酶系存在于胞液中,乙酰CoA必須通過枸櫞酸丙酮酸循環(huán)透過線粒體膜進入胞液才能成為合成脂肪酸的原料。乙酰CoA首先與草酰乙酸縮合生成枸櫞酸,轉(zhuǎn)運至胞液中裂解釋出乙酰CoA及草酰乙酸,乙酰CoA即可用以合成脂肪酸及膽固醇,而草酰乙酸則還原成蘋果酸被轉(zhuǎn)運入線粒體內(nèi)。蘋果酸也可在蘋
11、果酸酶作用下氧化脫羧生成丙酮酸,再轉(zhuǎn)運入線粒體內(nèi)。第六章生物氧化1.biologicalbiologicaloxidation:oxidation:即生物氧化即生物氧化,指物質(zhì)在生物體內(nèi)進行的氧化過程,主要是糖、脂肪、蛋白質(zhì)等在體內(nèi)分解時逐步釋放能量,最終生成二氧化碳和水的過程。其中相當(dāng)一部分能量可使ADP生成ATP,供生命活動的需要。2.P/O值:P/O比值是指物質(zhì)氧化時,每消耗1摩爾氧原子12摩爾氧氣分子所消耗的無機磷的摩爾數(shù),即生
12、成ATP的摩爾數(shù)。3.氧化磷酸化氧化磷酸化:代謝物脫下的2H在呼吸鏈傳遞過程中偶聯(lián)ADP磷酸化并生成ATP的過程,稱為氧化磷酸化(oxidativephosphylation)。氧化磷酸化是體內(nèi)產(chǎn)生ATP的主要方式。4.蘋果酸蘋果酸天冬氨酸穿梭天冬氨酸穿梭:是胞液中NADH穿梭至線粒體進行氧化的一種方式,通過此種方式,NADH在線粒體中進入NADH氧化呼吸鏈,生成了ATP分子。5解偶聯(lián)作用:使氧化與磷酸化偶聯(lián)過程脫離的作用,使呼吸鏈傳遞
13、電子過程中泵出的H不經(jīng)ATP合酶的F0質(zhì)子通道回流,而通過線粒體內(nèi)膜中其他途徑返回線粒體基質(zhì),從而破壞了內(nèi)膜兩側(cè)的電化學(xué)梯度,使ATP的生成受到抑制,由電化學(xué)梯度貯存的能量以熱能的形式釋放。6底物水平磷酸化:指物質(zhì)在脫氫或脫水過程中產(chǎn)生高能鍵,由于分子內(nèi)能量重排,使ADP生成ATP的過程。例如磷酸烯醇式丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)楸岬倪^程。7.αα磷酸甘油穿梭磷酸甘油穿梭:指線粒體外的NADH在胞液中磷酸甘油脫氫酶催化下,使磷酸二羥丙酮還原成α磷酸
14、甘油,后者通過線粒體外膜,再經(jīng)位于線粒體內(nèi)膜的磷酸甘油脫氫酶催化下氧化生成磷酸二羥丙酮和FADH2磷酸二羥丙酮可穿出線粒體外膜至胞液,繼續(xù)進行穿梭,而FADH2則進入琥珀酸氧化呼吸鏈,生成2分子ATP。主要存在于腦和骨骼肌中。第七章氨基酸代謝1.轉(zhuǎn)氨基作用轉(zhuǎn)氨基作用:氨基酸在轉(zhuǎn)氨酶催化下,可逆地把氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移給α酮酸,氨基酸脫去氨基,轉(zhuǎn)變成α酮酸,而α酮酸則接受氨基變成另一種氨基酸,稱為氨基酸的轉(zhuǎn)氨基作用。轉(zhuǎn)氨酶的輔酶是維生素B6的
15、磷酸酯,即磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺。2.嘌呤核苷酸循環(huán):骨骼肌和心肌主要通過嘌呤核苷酸循環(huán)進行脫氨基作用。氨基酸首先通過連續(xù)的轉(zhuǎn)氨基作用將氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移給草酰乙酸,生成天冬氨酸;天冬氨酸與次黃嘌呤核苷酸生成腺苷酸代琥珀酸,經(jīng)裂解生成AMP,AMP在腺苷酸脫氨酶催化下脫去氨基。由此可見,嘌呤核苷酸循環(huán)實際上也可以看成是另一種形式的聯(lián)合脫氨基作用。3.葡萄糖丙氨酸循環(huán):肌肉中的氨基酸將氨基轉(zhuǎn)給丙酮酸生成丙氨酸,經(jīng)血液到肝。在肝中脫去氨基,用
16、于合成尿素,生成的酮酸可轉(zhuǎn)成葡萄糖隨血液達到肌肉組織,經(jīng)糖分解途徑生成丙酮酸,再加氨基生成丙氨酸,稱為葡萄糖丙氨酸循環(huán)。該循環(huán)是肌肉與肝之間的氨運輸方式。4.transaminase:即轉(zhuǎn)氨基,催化某一氨基酸的氨基轉(zhuǎn)移到另一種酮酸的酮基上,生成相應(yīng)的氨基酸,原來的氨基酸則轉(zhuǎn)為酮酸。5.蛋氨酸循環(huán):蛋氨酸與ATP作用轉(zhuǎn)變成蛋氨酸(SAM),SAM是甲基的直接供體,參與許多甲基化反應(yīng);與此同時產(chǎn)生的S腺苷同型半胱氨酸進一步轉(zhuǎn)變成同型半胱氨
17、酸,后者可接受N5—CH3—FH4的甲基重新生成蛋氨酸,形成一個循環(huán)過程,稱蛋氨酸循環(huán)。其生理意義是:SAM提供甲基以進行體內(nèi)廣泛存在的甲基化反應(yīng)。②N5—CH3—FH4提供甲基合成蛋氨酸,同時使N5—CH3—FH4的FH4釋放,再參與一碳單位的代謝。6.氮平衡:機體內(nèi)蛋白質(zhì)代謝的情況可根據(jù)氮平衡實驗來確定,即測定尿與糞中的含氮量(排出氮)及攝入食物的含氮量(攝入氮)可以反映人體蛋白質(zhì)的代謝情況。①氮總平衡:攝入氮=排出氮,反映正常成人
18、的蛋白質(zhì)代謝情況,即氮的“收支”平衡。②氮正平衡:攝入氮>排出氮,部分?jǐn)z入的氮用于合成體內(nèi)蛋白質(zhì)。兒童、孕婦及恢復(fù)期患者屬于此種情況。③氮負(fù)平衡:排出氮>攝入氮。7.鳥氨酸循環(huán)鳥氨酸循環(huán):體內(nèi)的氨主要在肝經(jīng)鳥氨酸循環(huán)(尿素)合成鳥氨酸,使有毒的氨合成無毒的尿素,隨尿液排出體外。首先CO2和氨在氨基甲酰磷酸合成酶I(CPSI)催化下生成氨基甲酰磷酸,再與鳥氨酸縮合成瓜氨酸;瓜氨酸與天冬氨酸縮合成精氨酸代琥珀酸,后者裂解為精氨酸和延胡索酸;
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