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文檔簡介
1、傳染病是引起全世界畜牧業(yè)經(jīng)濟損失的最重要原因之一。羊口瘡病毒(Orf virus,ORFV)和羊痘病毒(Capripoxvirus,CaPV)是引起羊皮膚、粘膜皰疹和潰瘍的重要病毒;而豬圓環(huán)病毒Ⅱ型(Porcine circovims.type2,PCV2)、偽狂犬病毒(Porcine pseudorabies virus,PRV)及細小病毒(Porcine parvovirus virus,PPV)則是引起豬繁殖障礙的重要病毒??焖?、
2、簡單及特異性診斷在疫病防控中至關(guān)重要。重組酶聚合酶擴增(Recombinase polymerase amplification,RPA)是一種簡單、快速、敏感性高及特異性強的新型恒溫擴增技術(shù),能在37-42℃恒溫條件下,20 min內(nèi)完成檢測。本研究首次分別建立了快速檢測上述五種病毒的熒光探針和側(cè)流式免疫層析RPA檢測方法,并成功地應(yīng)用于田間樣品檢測。具體研究結(jié)果如下:
1.分別建立了快速檢測 ORFV(ORFV real-
3、time RPA)、CaPV(CaPV real-time RPA)、PCV2(PCV2 real-time RPA)、PRV(PRV real-time RPA)及PPV(PPV real-time RPA)的熒光探針RPA方法,其靈敏度分別為100拷貝/反應(yīng)、300拷貝/反應(yīng)、100拷貝/反應(yīng)、100拷貝/反應(yīng)和300拷貝/反應(yīng),并均能特異性的檢測相應(yīng)的病毒。利用上述建立的方法分別檢測相應(yīng)的田間樣品,并與相對應(yīng)的real-time
4、qPCR比較,檢出率分別為93%、94%、100%、93%及94%。
2.分別建立了快速檢測ORFV(ORFV RPA LFD)、CaPV(CaPVRPALFD)、PCV2(PCV2 RPALFD)、PRV(PRVRPA LFD)及PPV(PPV RPA LFD)的側(cè)流式免疫層析RPA方法,其靈敏度分別為80拷貝/反應(yīng)、300 DNA拷貝/反應(yīng)、100拷貝/反應(yīng)、160拷貝/反應(yīng)及400拷貝/反應(yīng),并均能特異性的檢測相應(yīng)的病毒
5、。利用上述建立的方法分別檢測相應(yīng)的田間樣品,并與相對應(yīng)的real-time qPCR比較,檢出率分別為95%、97%、100%、93%及94%。
3.為了能同時檢測樣品中的ORFV和CaPV,建立了ORFV和CaPV雙重熒光探針RPA方法(duplex real-time RPA),其檢測ORFV和CaPV DNA的靈敏度分別為1000拷貝/反應(yīng)和1200拷貝/反應(yīng)。為了能同時檢測PCV2、PRV及PPV,建立了多重熒光探針R
6、PA(multiplx real-timeRPA),其檢測PCV2、PRV及PPV靈敏度分別為10000拷貝/反應(yīng)、1000拷貝/反應(yīng)和1200拷貝/反應(yīng)。該兩種方法均具有很好的特異性。
4.將基于磁珠的核酸提取方法與RPALFD方法聯(lián)用,以適用于臨床樣品的現(xiàn)場診斷。
研究結(jié)果表明,本文建立的RPA方法在ORFV, CaPV, PCV2,PRV和PPV的檢測上具有簡單,快速,敏感性高和特異性強的特點。該方法既可應(yīng)用于
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