癌癥中TP53變異的研究.pdf

1、目的：腫瘤抑制基因TP53的突變是許多癌癥發(fā)生發(fā)展的重要危險因素之一，本次研究通過觀察TP53在癌癥中突變的普遍規(guī)律及個別癌癥中的突變特征，探尋TP53突變在不同癌癥中的相互關(guān)系。
　　方法：通過IARC TP53 Database數(shù)據(jù)庫中的TP53突變數(shù)據(jù)統(tǒng)計，對TP53突變位點，堿基置換，氨基酸置換，二級結(jié)構(gòu)中突變及氨基酸置換變異率進(jìn)行統(tǒng)計分析。
　　結(jié)論：
　　1.癌癥中TP53突變高發(fā)位點都集中在175，248

2、和273熱點上，不同癌癥高發(fā)的位點不同，肺癌中較為特殊的熱點為157和158。
　　2.大多數(shù)癌癥最為高發(fā)的堿基置換為CpG處的G:C>A:T置換，肝癌和肺癌以G:C>T:A置換最多見。
　　3.在所有癌癥中，以精氨酸>組氨酸最為常見，同時發(fā)生突變最多的氨基酸為精氨酸，除了肝癌中最易突變成絲氨酸外，其他大多數(shù)癌癥突變形成最多的為組氨酸及半胱氨酸。氨基酸分類后，最常見的突變?yōu)槭杷被?疏水氨基酸。
　　4.在二級結(jié)構(gòu)中

3、發(fā)生的突變占總體的68％。
　　5.大多數(shù)癌癥高發(fā)的突變?yōu)椋篟175H、R248W、R248Q、R273C、R273H、R282W。個別癌癥較有特異性的突變：R249S--肝癌；G245S--結(jié)直腸癌；C176F--食管癌；R280T、E285K--膀胱癌；Y220C、I195T--卵巢癌；V157F、R158L、R273L、R248L--肺癌；G245C--肺癌和頭頸部癌。
　　6.在聚類分析及相關(guān)性分析中發(fā)現(xiàn)，結(jié)直腸癌和