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文檔簡介
1、目的:
1.研究早期肺腺癌患者基因編碼區(qū)的RNA編輯現(xiàn)象。
2.研究腺苷脫氨酶1(Adenosine Deaminases that Act on RNA1,ADAR1)、腺苷脫氨酶2(Adenosine Deaminases that Act on RNA2,ADAR2)和鳥氨酸脫羧酶(Ornithine Decarboxylase,ODC)在肺腺癌中表達的臨床意義及預后價值。
3.研究抗酶蛋白抑制因子1
2、(Antizyme inhibitor1,AZIN1)的RNA編輯對A549細胞增殖與轉移的影響。
方法:
1.應用微流控芯片多重聚合酶聯(lián)反應與 RNA測序( microfluidics-based multiplex PCR and RNA sequencing)檢測早期肺腺癌患者基因編碼區(qū)的RNA編輯現(xiàn)象。應用熒光定量PCR(RT-qPCR)檢測肺腺癌腫瘤組織與癌旁正常組織中ADAR1、ADAR2和ODC的基因表
3、達水平。
2.應用免疫組織化學染色技術檢測ADAR1、ADAR2和ODC蛋白在肺腺癌腫瘤組織與癌旁正常組織中的表達,分析ADAR1與ODC在肺腺癌中表達的相關性和預后價值。
3.構建穩(wěn)定表達編輯型AZIN1基因的A549細胞(A549-edt/AZIN1)和穩(wěn)定表達野生型AZIN1基因的A549細胞(A549-wt/AZIN1)。應用XTT實驗和Transwell細胞侵襲實驗,研究AZIN1的RNA編輯對于A549增
4、殖和侵襲的影響,應用免疫印跡法檢測ODC蛋白的表達水平。
結果:
1.相對于癌旁正常組織,肺腺癌組織的RNA編輯水平升高。在肺腺癌腫瘤組織編輯水平最高的20個基因中,在基因編碼區(qū)的共涉及14個基因位點,包括:COG3,SRP9,COPA,SRP9,CACNA1D,RICTOR,ZNF669,METTL6, FLNA,AZIN1,C20orf30,PODXL,F(xiàn)LNB,PDZD7。
2. ADAR1基因和 O
5、DC基因在肺腺癌腫瘤組織中的表達顯著高于癌旁正常組織,P<0.05。ADAR2基因在肺腺癌腫瘤組織中的表達與癌旁正常組織無統(tǒng)計學差異,其中P>0.05。
3. ADAR1蛋白定位于細胞核,呈棕黃色或棕褐色顆粒。60.4%的肺腺癌組織ADAR1高表達,而癌旁正常組織僅20.8%為高表達,兩組差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。ADAR1蛋白的表達與肺腺癌患者的TNM分期和淋巴結轉移情況明顯相關(P<0.05);而與性別、年齡、吸煙
6、史、胸膜侵犯情況、腫瘤最大直徑和分化程度無明顯相關(P>0.05)。
4. ADAR2蛋白定位于細胞核,呈棕黃色或棕褐色顆粒。10.4%的肺腺癌組織ADAR2高表達,而癌旁正常組織中8.3%為高表達,兩組差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
5. ODC蛋白主要定位于細胞質,細胞漿呈棕黃色。56.3%的肺腺癌組織 ODC高表達,而癌旁正常組織僅12.5%為高表達,兩組差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。ODC蛋白的表達與
7、肺腺癌患者的TNM分期明顯相關(P<0.05);而與性別、年齡、吸煙史、胸膜侵犯情況、腫瘤最大直徑、分化程度和淋巴結轉移情況無明顯相關(P>0.05)。
6.經過秩相關性分析,肺腺癌患者中ADAR1與ODC的表達呈正相關(r=0.832, P<0.01)。生存分析顯示ADAR1與ODC的表達與預后相關。Cox比例風險回歸模型進行多因素生存分析顯示,ADAR1蛋白表達水平、TNM分期是影響肺腺癌患者預后的獨立因素。
7
8、.通過XTT實驗測試A549、A549-edt/AZIN1和A549-wt/AZIN1的增殖能力。第一天,三組細胞增殖未出現(xiàn)明顯的差異。第三天, A549-edt/AZIN1與A549-wt/AZIN1的增殖速度明顯高于 A549( P<0.05)。第六天, A549-edt/AZIN1的增殖速度明顯高于A549-wt/AZIN1(P<0.05)。
8.通過Transwell細胞侵襲實驗,比較A549,A549-edt/AZI
9、N1和A549-wt/AZIN1穿透Matrigel Invasion Chamber的侵襲能力,結果顯示:A549-edt/AZIN1(477±68)穿過小室的細胞數(shù)量明顯多于A549-wt/AZIN1(327±42)(P<0.05),即A549-edt/AZIN1的侵襲能力比A549-wt/AZIN1的侵襲能力強。
9.通過Western blot檢測A549-edt/AZIN1和A549-wt/AZIN1中ODC的表達量
10、,發(fā)現(xiàn) A549-edt/AZIN1和 A549-wt/AZIN1中 ODC的蛋白表達量高于 A549(P<0.05),且ODC在A549-edt/AZIN1的表達量高于A549-wt/AZIN1,差異具有統(tǒng)計學意義,P<0.05。
結論:
1.相對于癌旁正常組織,肺腺癌組織的RNA編輯水平升高。在肺腺癌腫瘤組織編輯水平最高的20個基因中,在基因編碼區(qū)的共涉及14個基因位點,包括:COG3,SRP9,COPA,SRP
11、9,CACNA1D,RICTOR,ZNF669,METTL6, FLNA,AZIN1,C20orf30,PODXL,F(xiàn)LNB,PDZD7。
2.肺腺癌患者腫瘤組織中ADAR1與ODC的表達明顯高于癌旁正常組織,二者在肺腺癌中的表達呈正相關。肺腺癌患者腫瘤組織與癌旁正常組織中ADAR2的表達無明顯差異,主要為低表達。ADAR1蛋白的表達與肺腺癌患者的TNM分期和淋巴結轉移情況明顯相關。ODC蛋白的表達與肺腺癌患者的TNM分期明顯
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