炎癥型腸癌及炎癌轉化模型中基因表達變化的初步研究.pdf

1、結直腸癌是最常見的惡性腫瘤之一，嚴重危害人類生命健康。根據(jù)基因表達情況，結直腸癌可分為5種亞型。其中之一為炎癥型腸癌。本研究利用生物信息學方法觀察了相關炎癥因子在人類炎癥型腸癌的表達變化，并建立了結腸炎相關結腸癌的小鼠模型，獲得了炎癌轉化小鼠模型的基因表達數(shù)據(jù)，并初步驗證了相關炎癥因子在動物模型中的表達變化，與人類炎癥型腸癌進行了對比。
　　第一部分：結直腸癌的分子分型是近來臨床關注和研究的重點和熱點。而炎癌轉化研究也越來越多地被

2、研究者所關注。大量研究提示并證實了炎癥轉化為腫瘤的過程的存在，但并非所有的腫瘤都由炎癥轉化而來。本研究僅關注炎癥型腸癌的若干炎癥因子基因表達變化。本部分研究使用TCGA數(shù)據(jù)庫下載的人類結直腸癌患者及癌旁組織的基因組數(shù)據(jù)，使用生物信息學方法，將結直腸癌分為包括炎癥型腸癌在內的5類，并分析了IL1A、IL1B、IL6、IL23A，NFKB2、 TGFB1、TGFB3、PTGS2幾個基因在人類炎癥型腸癌的變化情況。結果發(fā)現(xiàn)在TCGA數(shù)據(jù)庫64

3、7例腸癌中，98例腸癌被分型為炎癥型腸癌，在炎癥型腸癌中，上述8個基因均呈高表達。
　　第二部分：TCGA數(shù)據(jù)庫的樣本來源受地域、人種等因素影響，而針對不同遺傳背景、不同地區(qū)人群，臨床研究所取得的結果不盡相同。本部分研究使用我院臨床患者的樣本，使用生物信息學方法，將67例患者中的10例聚類至炎癥型腸癌，并分析了IL1A、L1B、IL6、L23A、NFKB2、TGFB1、TGFB3、PTGS2幾個基因在人類炎癥型腸癌的變化情況，結果

4、發(fā)現(xiàn)，上述幾個基因均呈高表達，且變化趨勢與TCGA數(shù)據(jù)庫的結果一致。
　　第三部分：動物模型在疾病的病理機制的研究中一直有著無可替代的作用。在炎癥相關性腸癌的動物模型中，AOM/DSS模型成瘤率高，周期短，最為常用。第三部分研究建立的AOM/DSS小鼠模型，作為結直腸炎癌轉化的動物模型，進行了AOM/DSS小鼠腫瘤的全基因組表達譜芯片實驗。結果發(fā)現(xiàn)，小鼠經(jīng)歷了正常→不典型增生或腺瘤→腸癌的變化過程。經(jīng)過3個周期的DSS處理后，小鼠

5、均生長了腫瘤。取不同處理周期的小鼠進行對比，發(fā)現(xiàn)隨著時間的推移，以及DSS處理周期的疊加，除Tgfb3基因外，小鼠的Il1a、Il1b、Il6、Il23a、Nfkb2、Tgfb1、Ptgs2幾個基因均為高表達，且高表達趨勢大致持續(xù)升高，與人類腸癌的8個基因的表達趨勢相同，而Tgfb3的表達下降。
　　總結第一部分、第二部分及第三部分研究的結果，我們認為人類結直腸癌是一類具有異質性的疾病，根據(jù)基因表達可進行進一步分子分型;無論在TC