炎癥型腸癌及炎癌轉(zhuǎn)化模型中基因表達(dá)變化的初步研究.pdf

1、結(jié)直腸癌是最常見的惡性腫瘤之一，嚴(yán)重危害人類生命健康。根據(jù)基因表達(dá)情況，結(jié)直腸癌可分為5種亞型。其中之一為炎癥型腸癌。本研究利用生物信息學(xué)方法觀察了相關(guān)炎癥因子在人類炎癥型腸癌的表達(dá)變化，并建立了結(jié)腸炎相關(guān)結(jié)腸癌的小鼠模型，獲得了炎癌轉(zhuǎn)化小鼠模型的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，并初步驗證了相關(guān)炎癥因子在動物模型中的表達(dá)變化，與人類炎癥型腸癌進(jìn)行了對比。
　　第一部分：結(jié)直腸癌的分子分型是近來臨床關(guān)注和研究的重點和熱點。而炎癌轉(zhuǎn)化研究也越來越多地被

2、研究者所關(guān)注。大量研究提示并證實了炎癥轉(zhuǎn)化為腫瘤的過程的存在，但并非所有的腫瘤都由炎癥轉(zhuǎn)化而來。本研究僅關(guān)注炎癥型腸癌的若干炎癥因子基因表達(dá)變化。本部分研究使用TCGA數(shù)據(jù)庫下載的人類結(jié)直腸癌患者及癌旁組織的基因組數(shù)據(jù)，使用生物信息學(xué)方法，將結(jié)直腸癌分為包括炎癥型腸癌在內(nèi)的5類，并分析了IL1A、IL1B、IL6、IL23A，NFKB2、 TGFB1、TGFB3、PTGS2幾個基因在人類炎癥型腸癌的變化情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn)在TCGA數(shù)據(jù)庫64

3、7例腸癌中，98例腸癌被分型為炎癥型腸癌，在炎癥型腸癌中，上述8個基因均呈高表達(dá)。
　　第二部分：TCGA數(shù)據(jù)庫的樣本來源受地域、人種等因素影響，而針對不同遺傳背景、不同地區(qū)人群，臨床研究所取得的結(jié)果不盡相同。本部分研究使用我院臨床患者的樣本，使用生物信息學(xué)方法，將67例患者中的10例聚類至炎癥型腸癌，并分析了IL1A、L1B、IL6、L23A、NFKB2、TGFB1、TGFB3、PTGS2幾個基因在人類炎癥型腸癌的變化情況，結(jié)果

4、發(fā)現(xiàn)，上述幾個基因均呈高表達(dá)，且變化趨勢與TCGA數(shù)據(jù)庫的結(jié)果一致。
　　第三部分：動物模型在疾病的病理機(jī)制的研究中一直有著無可替代的作用。在炎癥相關(guān)性腸癌的動物模型中，AOM/DSS模型成瘤率高，周期短，最為常用。第三部分研究建立的AOM/DSS小鼠模型，作為結(jié)直腸炎癌轉(zhuǎn)化的動物模型，進(jìn)行了AOM/DSS小鼠腫瘤的全基因組表達(dá)譜芯片實驗。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，小鼠經(jīng)歷了正?！坏湫驮錾蛳倭觥c癌的變化過程。經(jīng)過3個周期的DSS處理后，小鼠

5、均生長了腫瘤。取不同處理周期的小鼠進(jìn)行對比，發(fā)現(xiàn)隨著時間的推移，以及DSS處理周期的疊加，除Tgfb3基因外，小鼠的Il1a、Il1b、Il6、Il23a、Nfkb2、Tgfb1、Ptgs2幾個基因均為高表達(dá)，且高表達(dá)趨勢大致持續(xù)升高，與人類腸癌的8個基因的表達(dá)趨勢相同，而Tgfb3的表達(dá)下降。
　　總結(jié)第一部分、第二部分及第三部分研究的結(jié)果，我們認(rèn)為人類結(jié)直腸癌是一類具有異質(zhì)性的疾病，根據(jù)基因表達(dá)可進(jìn)行進(jìn)一步分子分型;無論在TC