蘋果銹果類病毒檢測體系的建立及傳播途徑探究.pdf

1、蘋果銹果類病毒(Apple skin scar viroid，ASSVd)是危害蘋果較為嚴重的非潛隱性病毒之一，也是我國蘋果的重要檢疫性有害生物。目前，國內(nèi)外關于ASSVd檢測方面研究較少，技術還不成熟，而且ASSVd傳播方式知之甚少，尚無有效的防治措施。因此，我們建立了ASSVd準確、靈敏、快速的RT-PCR檢測技術體系，同時，以攜帶ASSVd組培苗和無毒組培苗為試材，通過人工模擬田間不同傳播途徑，初步明確了在組培條件下ASSVd傳播

2、方式。本研究結果將為ASSVd的準確診斷提供可靠的方法，為果樹苗木檢疫、無毒苗木生產(chǎn)提供技術支撐。為阻止田間生產(chǎn)過程中ASSVd的侵入與傳播提供理論依據(jù)，為有效預防蘋果銹果病的發(fā)生奠定基礎。取得的主要研究結果如下:
　　1、揭示了ASSVd河北保定分離物的基因組序列及其分類地位。以采自河北保定的ASSVd樣本為試材，利用RT-PCR技術對樣本中的ASSVd全基因組序列進行擴增，然后利用生物學軟件MEGA6.0對該分離物與已發(fā)表的其

3、它分離物序列構建系統(tǒng)發(fā)育樹，對系統(tǒng)進化關系進行分析。結果表明，ASSVd保定分離物ASSVd BD-1基因組全長332nts，將序列提交到GenBank，登錄號為KR264032。該分離物與已發(fā)表的其它13個來自不同寄主、不同國家的ASSVd分離物間進化關系極近，核苷酸相似性為92％～99％之間。與加拿大蘋果上的分離物DAVd(GenBank登錄號:X71599)親緣關系最近，相似性為99％，僅在第221位有一個堿基差異，與新疆梨上的分

4、離物ASSVd-Z7（GenBank登錄號:JX861259）親緣關系最遠。系統(tǒng)發(fā)育分析表明:不同地區(qū)的ASSVd分離物聚類沒有規(guī)律性，ASSVd不存在地區(qū)?；?。新疆梨、桃、杏、蘋果不在同一分支，說明ASSVd可能存在一定的寄主特異性。二級結構預測表明，該分離物的中央保守區(qū)、末端保守區(qū)與ASSVd其它分離物相同。
　　2、建立了ASSVd常規(guī)RT-PCR及利用內(nèi)標nad5基因為基礎的RT-PCR檢測體系。根據(jù)GenBank中已發(fā)

5、表ASSVd基因組序列，選擇保守區(qū)域，設計引物。以感染ASSVd田間蘋果樣本為試材，對已報道引物及自行設計引物進行篩選，對常規(guī)和以內(nèi)標為基礎的RT-PCR檢測體系和程序進行優(yōu)化。結果表明，自行設計引物ASSVdQxin3特異性最好，優(yōu)化的常規(guī)PCR體系(25μL)中cDNA模板0.5μL、ASSVdQxin3-F/R引物(20pmol/μL)各1.0μL、ddH2O10μL、2×Es Taq MasterMix12.5μL;擴增程序中退

6、火溫度為64.4℃，循環(huán)次數(shù)為35，靈敏度達到能夠檢測3.75 ng新鮮樣本中的病毒。優(yōu)化的以內(nèi)標為基礎的PCR體系(25μL)中cDNA模板2μL、ASSVdQxin3-F/R引物(20pmol/μL)各1.0μL、nad5-F/R引物(20pmol/μL)各0.1μL、ddH2O8.3μL、2×Es Taq MasterMix12.5μL;擴增程序中退火溫度為60.9℃，循環(huán)次數(shù)為35，靈敏度達到能夠檢測37.5ng新鮮樣本中的病毒

7、。
　　3、明確了蘋果果實著色期最佳檢測部位為幼嫩韌皮部，內(nèi)標nad5基因為基礎的ASSVd RT-PCR檢測體系田間應用可靠性更高。利用優(yōu)化的檢測體系對蘋果果實著色期不同部位進行檢測，并驗證了兩種檢測體系的田間應用可靠性。結果表明，果實著色期，染病植株的幼嫩葉片、一年生枝條韌皮部和木質部、果實及部分種子樣本均能檢測到病毒，最佳檢測部位為幼嫩韌皮部，其在RT-PCR檢測中條帶亮度最高，特異性最好，且病毒檢出率為100％，而種子作為

8、檢測材料，檢出率為70％。利用內(nèi)標nad5基因為基礎的ASSVd RT-PCR檢測體系和常規(guī)RT-PCR檢測體系對保定市順平縣124株樣品進行檢測，常規(guī)檢測體系病毒檢出率為22.6％，以內(nèi)標為基礎的檢測體系避免了假陰性現(xiàn)象，病毒檢出率為24.2％。
　　4、明確了蘋果銹果病田間發(fā)病呈逐年加重趨勢，銹果病樹田間分布有明顯的發(fā)病中心。2012～20154年間對4個蘋果園銹果病田間顯癥情況進行了調(diào)查，2014年對其中3個果園進行了RT-

9、PCR檢測分析。結果表明:果園12012-2015年發(fā)病率分別為3.0％、6.0％、7.0％和10.0％;果園22012-2015年發(fā)病率分別為19.4％、24.7％、29.0％和34.4％;果園32014-2015年發(fā)病率分別為16.0％和22.0％;果園42014-2015年發(fā)病率分別為9.1％和12.1％，發(fā)病率均逐年增加。2014年通過對3個果園進行RT-PCR檢測分析發(fā)現(xiàn)，銹果病樹田間分布有明顯的發(fā)病中心，尤其2012年顯癥果

10、樹的周圍發(fā)病中心明顯。說明銹果病傳播及顯癥需要一定的時間，顯癥受植株個體差異和外界氣候等因素影響較大，推測可能通過根接傳播。
　　5、明確了組培條件下ASSVd的傳播途徑。以攜帶ASSVd的組培苗和無毒組培苗為試材，通過模擬田間不同傳播方式，運用RT-PCR檢測技術，最終明確ASSVd可通過汁液沾染、根部吸收（根系緊密接觸、含病毒培養(yǎng)基質）、組培工具交叉使用進行傳毒，其中根系傳毒是風險最高的傳播途徑;組培剪用75％酒精消毒后仍存在