三羧酸循環(huán)通路關(guān)鍵基因單核苷酸多態(tài)性與大腸癌預(yù)后的相關(guān)性研究.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、大腸癌(colorectal cancer,CRC)是第三大惡性腫瘤,是全球癌癥發(fā)病率和死亡率的主要原因,最近,在原來一些發(fā)病率相對(duì)較低的地方發(fā)現(xiàn)大腸癌的發(fā)病率有上升趨勢(shì),尤其是中國。近年來,遺傳因素在大腸癌發(fā)生及進(jìn)展中的作用越來越多地為人們所關(guān)注,其中單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是反應(yīng)人類遺傳背景最常見的變異形式。但到目前為止,與大腸癌預(yù)后顯著相關(guān)的SNP位點(diǎn)少見報(bào)道,同時(shí),由

2、于 SNP在人群、種屬之間的遺傳差異,國外研究的顯著性SNP位點(diǎn)在我國漢族人群中未必能夠得到驗(yàn)證。所以,尋找能夠評(píng)估我國漢族人群大腸癌預(yù)后更加特異、敏感的SNP位點(diǎn)成為亟待解決的問題。
  代謝改變是腫瘤的十大特征之一并顯著影響腫瘤的發(fā)生及進(jìn)展。三羧酸循環(huán)(Tricarboxylic acid,TCA)是線粒體內(nèi)三大營養(yǎng)物質(zhì)(糖類、脂類、氨基酸)的共同代謝通路。琥珀酸脫氫酶(Succinate dehydrogenase,SDH)

3、、異檸檬酸脫氫酶(Isocitrate dehydrogenase,IDH)和延胡索酸水合酶(Fumarate hydratase,F(xiàn)H)是羧酸循環(huán)通路內(nèi)的三個(gè)關(guān)鍵限速酶,隨著人們對(duì)腫瘤相關(guān)分子機(jī)制認(rèn)識(shí)的不斷深入,越來越多的證據(jù)表明三羧酸循環(huán)通路分子 SDH、IDH、FH在多種腫瘤的發(fā)生及進(jìn)展中發(fā)揮著重要作用。多項(xiàng)研究證實(shí)用Si-RNA抑制IDH2表達(dá)可以抑制大腸癌細(xì)胞生長,而過表達(dá)該基因明顯促進(jìn)細(xì)胞增殖。細(xì)胞和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)均發(fā)現(xiàn)了SDHB

4、表達(dá)下調(diào)與大腸癌組織分化相關(guān)且上調(diào)SDHB可以抑制大腸癌細(xì)胞生長與增殖。人群研究中也陸續(xù)報(bào)道了SDH、IDH、FH基因突變且直接或間接證據(jù)表明上述突變與大腸癌發(fā)生及進(jìn)展相關(guān),但目前國內(nèi)外尚未開展上述基因SNP位點(diǎn)與大腸癌預(yù)后方面的研究。
  目的:
  探討三羧酸循環(huán)通路中SDH、IDH和FH基因的功能性SNPs位點(diǎn)與大腸癌預(yù)后的相關(guān)性,為大腸癌預(yù)后評(píng)估提供潛在的分子標(biāo)志物。
  方法:
  我們以在第四軍醫(yī)大學(xué)

5、唐都醫(yī)院及西京醫(yī)院接受大腸癌根治手術(shù)且未接受術(shù)前治療的患者為研究對(duì)象,采用前瞻性隊(duì)列研究方法,自2006年5月開始采集血液樣本,同時(shí)系統(tǒng)收集臨床信息并進(jìn)行規(guī)范化隨訪,截止2012年6月累計(jì)收集具有齊全臨床信息的大腸癌血液樣本697例。然后選取SDH、IDH和FH中的16個(gè)功能性SNPs位點(diǎn),利用飛行時(shí)間質(zhì)譜生物芯片系統(tǒng)(MassARRAY?)進(jìn)行SNP分型檢測(cè),結(jié)合臨床信息及隨訪資料,對(duì)SNP位點(diǎn)與CRC預(yù)后關(guān)系進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。

6、  結(jié)果:
  1、我們?cè)?個(gè)基因上發(fā)現(xiàn)了4個(gè)SNP位點(diǎn)(SDHC rs12064957、SDHC rs4131826、SDHD rs544184、SDHD rs7121782)與大腸癌(CRC)生存生存風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān);在3個(gè)基因上發(fā)現(xiàn)了5個(gè)SNP位點(diǎn)(SDHC rs4131826,SDHD rs10789859、rs544184、rs7121782,F(xiàn)H rs12071124)與大腸癌(CRC)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān);2、在進(jìn)一步的累積

7、效應(yīng)分析中我們發(fā)現(xiàn),危險(xiǎn)基因型數(shù)在大腸癌(CRC)的死亡和復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)分析中呈現(xiàn)明顯的數(shù)量累積效應(yīng),(P均小于0.001);3、STREE軟件對(duì)各顯著SNPs位點(diǎn)進(jìn)行生存樹分析顯示:SDHC基因中rs4131826位點(diǎn)是影響大腸癌(CRC)的死亡風(fēng)險(xiǎn)最重要的位點(diǎn),F(xiàn)H基因rs12071124位點(diǎn)是影響復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)最重要的位點(diǎn)。
  結(jié)論:
  我們的研究提示:三羧酸循環(huán)通路代謝酶基因功能性SNPs可能與大腸癌患者預(yù)后明顯相關(guān),該結(jié)論

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