GBM強化與壞死的比例(C∶N)與信號傳導(dǎo)通路相關(guān)性的研究.pdf

1、目的: 探討多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤（GBM）的磁共振（magnetic resource imaging，MRI）增強圖像特征中強化與壞死比例的高低與腫瘤信號傳導(dǎo)通路之間的相關(guān)性。
　　 方法: 收集徐醫(yī)附院病理證實為WHO Ⅳ級的GBM（C:N）的腫瘤標(biāo)本6例及磁共振圖像，腫瘤標(biāo)本取出后立即投入液氮中保存。采用Unizol法分別提取總RNA，經(jīng)驗證RNA沒有降解后經(jīng)純化后制備成cRNA與illumina芯片雜交，通過FDR法以及基

2、因芯片的雙倍信號為雙重標(biāo)準(zhǔn)篩選出腫瘤差異表達基因。以C:N（≤1.0、1.0-3.0、≥3.0）比例為秩次，基因表達高低為秩次，通過Spearman等級相關(guān)分析C:N與差異基因表達的相關(guān)性，尋找隨C:N比例增高而增高或降低的相關(guān)基因，將實驗數(shù)據(jù)與信號傳導(dǎo)通路的生物學(xué)數(shù)據(jù)庫KEGG等數(shù)據(jù)庫相連接，行Pathway分析。
　　 結(jié)果:
　　 1、通過Spearman等級相關(guān)分析，各從其中挑選9條基因，C:N比例與下列幾個基因

3、呈正相關(guān)關(guān)系：G1-S-specific cyclin E、Cytoplasmic nuclear factor of activated T cells、EGFR、IGFBP-1、 OX40 ligand 、Cysteine protease 、Endothelin receptor type B 、Nuclear factor I–X、 Cyclin D2。
　　 2、C:N比例與下列幾個基因呈負(fù)相關(guān)關(guān)系：Ras-relat

4、ed protein RAB3A、DNAse I-like、Akt、DNA ligase IV、Estrogen Sulfotransferase、Transforming growth factor-α、Muscle-specific DNAse I-like、Ephrin type A receptor 1、Inhibitor DNA binding- 4。
　　 3、通過聯(lián)系文獻及數(shù)據(jù)庫，EGFR signal pathw

5、ay 的基因表達與C:N的比例成正相關(guān)關(guān)系。Ras-raf signal pathway、PI3K-Akt-NF-κBsignal pathway的基因表達與C:N的比例成負(fù)相關(guān)關(guān)系。
　　 結(jié)論:
　　 1、GBM實質(zhì)與壞死比例(C:N)與腫瘤的EGFR信號傳導(dǎo)通路成正相關(guān)關(guān)系，當(dāng)C:N比例較高時針對EGFR信號傳導(dǎo)通路的個體化治療可能能改善預(yù)后。
　　 2、GBM實質(zhì)與壞死比例(C:N)與細(xì)胞內(nèi)Ras，PI3