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文檔簡(jiǎn)介
1、辣椒疫霉菌(Phytophthora capsici)是一種極具破壞性的絲狀植物病原體,其分布廣泛,能夠引起全世界范圍的辣椒疫霉病,對(duì)全球農(nóng)業(yè)和自然生態(tài)系統(tǒng)具有重要的影響(Fisher et al.,2012)。當(dāng)前辣椒疫霉主要以施用化學(xué)藥劑進(jìn)行防治,但重金屬超標(biāo)、農(nóng)藥殘留等問(wèn)題日益突出,在解決問(wèn)題的同時(shí),也給辣椒生產(chǎn)、人類生活健康和生態(tài)環(huán)境安全帶來(lái)了巨大的威脅和傷害。因此,利用分子生物學(xué)技術(shù)探索辣椒疫霉菌重要的致病因子及其致病機(jī)制越來(lái)
2、越成為研究的熱點(diǎn)。
提高寄主植物的抗病性是控制辣椒疫霉病的最有效的措施。在辣椒疫霉侵染寄主的過(guò)程中,病原菌能夠分泌大量的RxLR效應(yīng)分子,促進(jìn)和破壞寄主植物的抗病反應(yīng)。因此,研究RxLR效應(yīng)分子基因的功能和蛋白結(jié)構(gòu),對(duì)了解辣椒疫霉的致病機(jī)制,有效控制辣椒疫霉的侵染具有重要意義。
本項(xiàng)研究以本實(shí)驗(yàn)室采集并分離保存的高致病性辣椒疫霉菌株SD33為實(shí)驗(yàn)材料,結(jié)合相關(guān)的研究基礎(chǔ),對(duì)辣椒疫霉菌株SD33中的細(xì)胞周期調(diào)控蛋白Pc
3、sda1和RxLR效應(yīng)分子基因進(jìn)行了如下研究:
1、利用生物學(xué)軟件從JGI辣椒疫霉菌基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選得到Pcsda1基因和RxLR效應(yīng)分子基因核苷酸及氨基酸序列,通過(guò)NCBI進(jìn)行BLASTn及BLASTp比對(duì),確定篩選出的基因的正確性。
2、從本實(shí)驗(yàn)室保存的高致病性辣椒疫霉菌株SD33中提取的基因組DNA中,克隆Pcsda1基因和RxLR效應(yīng)分子基因;
3、利用軟件對(duì)Pcsda1基因和RxLR效應(yīng)分子基因
4、進(jìn)行生物信息學(xué)預(yù)測(cè)和分析。
4、將Pcsda1基因融合GFP蛋白在辣椒疫霉SD33中表達(dá),發(fā)現(xiàn)Pcsda1基因定位在辣椒疫霉SD33的細(xì)胞核中,據(jù)此,可以推測(cè)目的基因Pcsda1通過(guò)影響辣椒疫霉菌細(xì)胞核的形成和發(fā)育,進(jìn)而影響菌絲及孢子囊的正常生長(zhǎng)發(fā)育。
5、用鬼筆環(huán)肽染色法檢測(cè)Pcsda1基因沉默轉(zhuǎn)化子、過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)化子和對(duì)照轉(zhuǎn)化子的菌絲和孢子囊時(shí)期的肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架,發(fā)現(xiàn)沉默轉(zhuǎn)化子和過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)化子在菌絲和孢子囊中肌動(dòng)蛋白
5、的分布不規(guī)則,過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)化子中,肌動(dòng)蛋白的數(shù)量增多,尤其是菌絲中,肌動(dòng)蛋白變成細(xì)長(zhǎng)、棍棒狀、更加明亮。因此,Pcsda1可以調(diào)節(jié)肌動(dòng)蛋白斑塊和肌動(dòng)蛋白絲的分布和形態(tài),尤其是在菌絲中。
6、利用pBIN-GFP2表達(dá)載體對(duì)辣椒疫霉RxLR效應(yīng)分子進(jìn)行功能研究,在本氏煙中表達(dá)4個(gè)候選效應(yīng)分子,發(fā)現(xiàn)其中129113基因可以誘導(dǎo)本氏煙草發(fā)生細(xì)胞死亡,129113、101860可以抑制Bax、INF1、CRN4誘導(dǎo)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)。
6、> 7、為了進(jìn)一步研究RxLR的功能,對(duì)4個(gè)RxLR效應(yīng)分子進(jìn)行亞細(xì)胞定位,發(fā)現(xiàn)定位在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中。將129113基因的C端與核輸出信號(hào)(NES)和核定位信號(hào)(NLS1和NLS2)融合,發(fā)現(xiàn)NLS2、NES都改變了129113的定位而NLS1沒(méi)有改變129113的定位。改變129113的定位,影響了其在寄主植物細(xì)胞中的功能。推測(cè)129113在植物細(xì)胞中起作用有可能發(fā)生在細(xì)胞質(zhì)中。
通過(guò)本研究,我們可以推測(cè)4個(gè)RxLR效應(yīng)
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