與鴨坦布蘇病毒E蛋白相互作用的宿主蛋白的篩選.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、坦布蘇病毒(Tembusu virus,TMUV)感染是我國2010年新發(fā)生的一種傳染性疾病,該病以種鴨、蛋鴨產(chǎn)蛋下降、雛鴨癱瘓為特征。TMUV感染可危害多個品種鴨,包括北京鴨、櫻桃谷鴨、紹興鴨、金定鴨、龍巖鴨和山麻鴨等。依據(jù)發(fā)病日齡的不同,感染鴨群的死亡率為5~30%,發(fā)病率可達90%以上。目前該病在全國水禽養(yǎng)殖地區(qū)均有發(fā)病和流行,給我國養(yǎng)鴨業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟損失。DTMUV是單股正鏈RNA病毒,其基因組編碼3個結(jié)構(gòu)蛋白(衣殼蛋白、前

2、膜蛋白、囊膜蛋白)和7個非結(jié)構(gòu)蛋白(NS1、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B、NS5)。其中E蛋白是坦布蘇病毒主要的結(jié)構(gòu)蛋白,在病毒的吸附、穿入、宿主范圍、病毒毒力、病毒與細胞膜的融合以及病毒粒子在細胞內(nèi)的包裝過程中發(fā)揮著重要作用。此外E蛋白也是重要的抗原分子,包含多個抗原決定簇,可以通過誘發(fā)中和抗體產(chǎn)生保護性免疫應答。本研究以期發(fā)現(xiàn)與E蛋白相互作用的宿主因子,拓展現(xiàn)有的坦布蘇病毒與宿主相互作用網(wǎng)絡,為闡述坦布蘇病毒的的致

3、病機制,提出新的疾病防控思路提供理論依據(jù)。本研究包括以下兩個部分:
  1.鴨胚成纖維細胞cDNA文庫的構(gòu)建
  取10日齡SPF鴨胚,制備鴨胚成纖維細胞(DEF)。收集第2代鴨胚成纖維細胞,采用Trizol法提取鴨胚成纖維細胞總RNA。以總RNA為模板,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈。通過LD-PCR技術(shù)合成雙鏈cDNA,經(jīng)CHROMA SPIN TE-400 column純化去除小分子雙鏈cDNA后,將純化的雙鏈cDNA與pG

4、ADT7載體連接形成重組質(zhì)粒。利用同源重組的方法將構(gòu)建的重組質(zhì)??寺〉結(jié)187酵母感受態(tài)細胞,構(gòu)建了鴨胚成纖維細胞的cDNA文庫,并對構(gòu)建的cDNA文庫進行鑒定。結(jié)果,構(gòu)建的文庫滴度為3×107 cfu/mL,文庫插入的雙鏈cDNA片段大小為500~2250 bp,平均大小約為1.0 kb,符合酵母雙雜交篩選的要求。
  2.與DTMUV E蛋白相互作用的宿主蛋白的篩選
  采用Trizol法提取DTMUV RNA,RT-P

5、CR方法擴增E基因,將E基因與載體pGBKT7分別進行雙酶切,酶切產(chǎn)物連接后轉(zhuǎn)化DH5α大腸桿菌感受態(tài)細胞,通過抗性篩選獲得陽性克隆,提取質(zhì)粒,進行雙酶切鑒定并測序。將構(gòu)建的誘餌質(zhì)粒pGBKT7-E和空載體pGBKT7分別轉(zhuǎn)化Y2H感受態(tài)細胞,觀察其在SD/-Trp平板上的生長情況;將誘餌質(zhì)粒pGBKT7-E轉(zhuǎn)化Y2H感受態(tài)細胞,觀察其在SD/-Trp、SD/-Trp/X-α-Gal/AbA平板上的生長情況及菌落顏色的變化。利用pGBK

6、T7-E誘餌質(zhì)粒對鴨胚成纖維細胞cDNA文庫進行篩選,得到陽性文庫質(zhì)粒,根據(jù)序列比對分析結(jié)果。結(jié)果,經(jīng)雙酶切鑒定和測序分析,確定誘餌質(zhì)粒pGBKT7-E構(gòu)建成功;誘餌質(zhì)粒pGBKT7-E在SD/-Trp、SD/-Trp/X-α-Gal/AbA平板上不能生長,且在SD/-Trp平板上的生長情況與空載體pGBKT7并無太大區(qū)別,驗證了誘餌質(zhì)粒pGBKT7-E無自激活活性和毒性;通過酵母雙雜交從鴨胚成纖維細胞cDNA文庫中篩選得到了ANTX1

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