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文檔簡介
1、目的:
對肝細胞癌與健康對照的外周血全基因表達譜進行檢測,分析篩選其差異表達基因。
材料與方法:
應(yīng)用Affymetrix基因芯片技術(shù)平臺的人類全基因表達譜芯片技術(shù),檢測15例臨床確診的肝細胞癌患者和15例年齡、性別等相匹配的健康人的外周血基因表達譜,利用Gene Spring11.0軟件采用t-test unequal unpaired算法,計算P<0.05時的差異表達基因并按差異倍數(shù)排序,利用Gene
2、Spring軟件及DAVID Bioinformatics Resources6.7對前期篩選的差異表達基因進行聚類分析,GO分析和Pathway分析。
結(jié)果:
基因表達譜芯片分析發(fā)現(xiàn)597個有顯著差異表達的探針組(差異倍數(shù)≥2倍,P<0.05),共涉及434個基因,其中95個基因在肝癌患者外周血中表達顯著上調(diào),339個基因表達顯著下調(diào)。在肝癌患者中表達上調(diào)的基因主要與蛋白質(zhì)代謝過程、離子轉(zhuǎn)運等生物學(xué)過程有關(guān),主要參
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