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文檔簡(jiǎn)介
1、腸道病毒71型(enterovirus71,EV71)為小RNA病毒科腸道病毒屬的成員,是引起嬰幼兒手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的主要病原體之一。輕癥患者只引起發(fā)熱、皰疹等癥狀,重癥患者會(huì)引起嚴(yán)重的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(central nervous system,CNS)癥狀如無(wú)菌性腦膜炎、腦干腦炎、脊髓灰質(zhì)炎樣麻痹等,病死率較高。目前EV71的致病機(jī)制尚不明確,不同臨床癥狀的產(chǎn)生可能是由于病毒
2、毒力不同,也可能是個(gè)體易感性的不同。
本研究首先采集HFMD患兒的糞便標(biāo)本,運(yùn)用RD細(xì)胞分離腸道病毒并對(duì)其進(jìn)行EV71的鑒定;其次對(duì)EV71的全基因組序列進(jìn)行分析,尋找基因組序列上的差異;最后分別在5' UTR、VP2、3D區(qū)的基礎(chǔ)上對(duì)EV71的致病機(jī)制進(jìn)行研究,以尋找EV71致神經(jīng)系統(tǒng)病變的原因,為闡明EV71的致病機(jī)制提供重要基礎(chǔ)。
目的:
1.從HFMD患者的糞便標(biāo)本中分離EV71,為進(jìn)一
3、步的序列研究提供基礎(chǔ)。
2.了解山東省臨沂市分離的EV71病毒株的全基因組序列特征,尋找不同臨床癥狀病毒株基因組序列上的差異,為進(jìn)一步研究提供毒力候選位點(diǎn)。
3.對(duì)EV715' UTR、VP2、3D區(qū)的毒力候選位點(diǎn)進(jìn)行研究,探索EV71的致病機(jī)制。
方法:
1.將采集自2009~2010年山東省臨沂市HFMD患者的糞便標(biāo)本進(jìn)行處理,接種于RD細(xì)胞進(jìn)行初步分離,運(yùn)用腸道病毒通用引物及
4、EV71特異性引物對(duì)分離到的病毒RNA進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,篩選出EV71。
2.根據(jù)GenBank中EV71的基因組序列設(shè)計(jì)引物,對(duì)SDLY11病毒株進(jìn)行全基因組序列擴(kuò)增并測(cè)序,運(yùn)用DNAstar和MEGA4軟件對(duì)EV71的全基因組序列進(jìn)行分析。
3.根據(jù)SDLY01、SDLY11、SDLY48、SDLY96、SDLY107、SDLY153病毒株的全基因組序列設(shè)計(jì)引物,對(duì)8株EV71的5'UTR區(qū)進(jìn)行RT-
5、PCR擴(kuò)增并序列分析。
4.參考SDLY11、SDLY107全序列測(cè)序結(jié)果設(shè)計(jì)VP2、3D區(qū)擴(kuò)增引物,以構(gòu)建表達(dá)載體VP2-pBluescriptSK(+)、3D-Flag-pcDNA3.1,通過(guò)體外轉(zhuǎn)染細(xì)胞來(lái)表達(dá)蛋白,并檢測(cè)蛋白的致細(xì)胞病變作用。乳酸脫氫酶實(shí)驗(yàn)(LDH)檢測(cè)不同臨床癥狀病毒株的VP2蛋白、3D蛋白對(duì)細(xì)胞損傷的影響,Annexin-V與PI的聯(lián)合使用可檢測(cè)3D蛋白引起的細(xì)胞凋亡情況,通過(guò)MTT實(shí)驗(yàn)來(lái)檢測(cè)3D
6、蛋白對(duì)細(xì)胞增殖的影響。
結(jié)果:
1.本研究分離了2009~2010年的24份標(biāo)本,經(jīng)初步鑒定20份標(biāo)本為EV71,4份標(biāo)本為非EV71的腸道病毒,其中采集自2009年的22份樣本中有18例為EV71(81.8%)。
2.SDLY11病毒株基因組全長(zhǎng)7405nt,5'UTR包含742nt,3'UTR包含84nt,中間為6579nt的ORF,編碼2193個(gè)氨基酸的多聚蛋白。經(jīng)序列分析顯示,SDLY1
7、1屬于EV71的C4亞型。通過(guò)輕重癥患者病毒株進(jìn)行比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)5' UTR中的2處核苷酸突變(T40C、C575T)及VP2區(qū)的氨基酸突變(T144S)可能與病毒引起不同臨床癥狀有關(guān)。
3.8株EV71分離株的5'UTR區(qū)核苷酸序列為741nt~745nt,與C4亞型的同源性最高,不同臨床癥狀病毒株的5' UTR進(jìn)行序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)有2處核菅酸位點(diǎn)突變(G265A、G703T)。
4.SDLY11、SDLY107
8、兩個(gè)病毒株的VP2蛋白均可在Vero細(xì)胞中表達(dá),LDH實(shí)驗(yàn)對(duì)VP2蛋白引起的細(xì)胞損傷程度進(jìn)行分析,結(jié)果顯示兩組未出現(xiàn)明顯不同。
5.SDLY11、SDLY107的3D蛋白可在RD細(xì)胞中表達(dá),LDH實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示SDLY11株3D蛋白轉(zhuǎn)染組造成的細(xì)胞損傷程度大于SDLY107株3D蛋白轉(zhuǎn)染組,細(xì)胞凋亡結(jié)果未有明顯不同,而進(jìn)一步的MTT實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,SDLY107株3D蛋白轉(zhuǎn)染組的細(xì)胞增殖能力強(qiáng)于SDLYll株3D蛋白轉(zhuǎn)染組。<
9、br> 結(jié)論:
1.初步判定2009年山東省臨沂市流行的HFMD以EV71為主,SDLY11為C4亞型,為近年來(lái)中國(guó)大陸地區(qū)流行的EV71亞型。
2.5' UTR區(qū)的4處突變(T40C、G265A、C575T、G703T)可能與病毒產(chǎn)生的神經(jīng)系統(tǒng)癥狀相關(guān),這可為進(jìn)一步的研究提供候選位點(diǎn)。
3.不同臨床癥狀病毒株的VP2蛋白可能對(duì)細(xì)胞損傷的影響不大,但3D蛋白會(huì)引起細(xì)胞損傷情況、細(xì)胞增殖能力
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