華支睪吸蟲診斷抗原基因的篩選、克隆和生物信息學分析.pdf

1、[目的]
　　 用陽性血清篩選華支睪吸蟲成蟲cDNA表達文庫,以其篩選到新的序列,研究其功能,希望成為新的診斷抗原基因為華支睪吸蟲的診斷制劑的研發(fā)、抗華支睪吸蟲病藥物的新靶藥點的發(fā)現(xiàn)甚至為候選疫苗的研制提供重要的研究基礎(chǔ)。
　　 [方法]
　　 1.華支睪吸蟲成蟲cDNA文庫的免疫學篩選:
　　 免疫篩選血清的收集;抗血清預吸收;宿主菌的制備;cDNA文庫的免疫學篩選;定位并挑取其中的2個陽性克隆。

2、>　　 2.2個新序列的擴增、測序和克隆:
　　 2個陽性克隆PCR鑒定;PCR產(chǎn)物的純化回收;純化的DNA片段與克隆載體連接并轉(zhuǎn)化;質(zhì)粒的提取和雙酶切;測序;設(shè)計引物、2個新序列的PCR、克隆與質(zhì)粒的提取、酶切;新基因序列的片段與表達載體的連接和轉(zhuǎn)化。
　　 3.對篩選到的新序列進行生物信息學分析:
　　 使用DNA star軟件中的Editseq程序進行一級結(jié)構(gòu)的分析,包括開放閱讀框、氨基酸組成、蛋白質(zhì)相對

3、分子質(zhì)量、理論等電點等;使用在線HNN軟件進行二級結(jié)構(gòu)的分析,包括α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角、無規(guī)卷曲等;使用Expasy軟件對拓撲結(jié)構(gòu)和跨膜螺旋的預測;使用BLASTx程序進行基因的比對和同源性分析;使用Expasy軟件中的NetPhos程序進行特定位點分析;使用SignaIP軟件進行信號肽序列分析;使用IEDB AnalysisRecource在線分析工具進行抗原表位和親水性分析;使用rpsblast對結(jié)構(gòu)域分析等等。
　　 [結(jié)果

4、]
　　 對華支睪吸蟲成蟲cDNA文庫進行免疫學篩選,篩選到了12個陽性克隆,對其中的2個陽性克隆進行了亞克隆,預測了其片段長度。2個陽性克隆序列編碼蛋白分別與CD63抗原和Lumenin蛋白保護信使同源性最高,生物信息學分析得出2個編碼蛋白均是膜蛋白,可能的亞細胞定位在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔中,都有潛在的B細胞抗原表位、信號肽和跨膜螺旋等等。
　　 [結(jié)論]
　　 華支睪吸蟲成蟲cDNA文庫的篩選,找到了有潛在免疫學價值的診