草魚呼腸孤病毒拮抗宿主細胞RNA干擾信號通路的機制研究.pdf

1、草魚呼腸孤病毒隸屬于水生呼腸孤病毒屬，是引起草魚出血病的主要病原。該病毒基因組由11條雙鏈RNA組成，共編碼7個結構蛋白和5個非結構蛋白。GCRV導致宿主細胞融合、凋亡、應急顆粒產(chǎn)生等病理變化。GCRV的雙鏈RNA能夠在病毒正常復制周期避免結合Dicer并逃逸宿主RNAi抗病毒作用通路。
　　本文利用RACE技術、Real-time PCR、細胞轉染等方法對以下三個方面進行研究：
　　1.草魚Dicer基因的克隆與表達

2、>　　在RNAi介導的沉默機制中, Dicer發(fā)揮著重要的作用。本研究通過同源克隆方法和RACE技術獲得草魚Dicer cDNA序列,其開放閱讀框為5646bp，編碼1881個氨基酸。草魚 Dicer含有其他生物 Dicer的所有結構域。在草魚腦、鰓、頭腎、肝臟、脾臟、心臟、肌肉、和腸8個不同組織中, Dicer基因均有分布。GCRV感染CIK細胞條件下，Dicer表達在24h時上調，與對照組顯著性差異。同樣在Poly(I:C)刺激CI

3、K細胞條件下，Dicer表達在2h時上調，與對照組顯著性差異。不同組織的時序表達研究結果顯示,在肝臟中,草魚 Dicer在病毒感染12h時表達量開始上調,且與對照組有顯著性差異,72h時恢復到正常水平;而在脾臟組織的表達模式和肝臟的表達模式相似。同時，進行草魚Dicer的原核表達，蛋白純化和多克隆抗體的制備。
　　2.鑒定拮抗宿主RNAi的病毒蛋白
　　將病毒的12個基因構建到pEGFP-N1真核表達載體，并表達EGFP融合

4、蛋白。將重組質粒和GFP(熒光蛋白基因)特異性的shRNA共轉染到CIK細胞中。轉染后,用熒光顯微鏡觀察 GFP蛋白的熒光強度，并實時定量 PCR(qRT-PCR)檢測 GFP mRNA的表達量,確定NS31蛋白是病毒編碼抑制RNAi的蛋白。
　　本研究成功克隆草魚 Dicer基因、并對 GCRV和Poly(I:C)產(chǎn)生免疫應答，這為草魚的抗病免疫應答機理提供了新思路。初步鑒定NS31是抑制宿主RNAi的病毒蛋白，這加深了對病毒復