一株O型口蹄疫病毒分離株的全基因序列分析.pdf

1、本文對一株O型口蹄疫病毒分離株的全基因序列進行了分析。本研究以牛FMDV分離株HLJOC12/03細胞培養(yǎng)毒為材料，提取病毒總RNA，以提取的RNA為模板，根據(jù)參考序列設計合成特異性引物，通過RT-PCR方法獲得了此株病毒基因組的核苷酸序列，并將其克隆到pMD18-T載體上，轉化宿主菌TGl感受態(tài)細胞中，經(jīng)PCR、酶切鑒定以及測序證明得到了此株病毒各段基因。利用DNAStar軟件包中的SepMan軟件進行序列拼接，基因組測得的5’非編碼

2、區(qū)(5'UTR)長1052個核苷酸(nt)，IRES長455nt；L編碼區(qū)基因長603nt，編碼201個氨基酸(aa);P1編碼區(qū)基因長2002nt，編碼734aa; P2編碼區(qū)基因長1470nt，編碼490aa;P3編碼區(qū)基因長2721nt，編碼907aa;3’LJTR從TAA始至poly(A)前長93nt，所測出poly(A)尾長度為16nt；由此本毒株已測得基因長為8158nt，編碼區(qū)長6999nt，編碼2332aa，將所得序列與