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文檔簡介
1、目的:確定BACE1基因啟動子的核心區(qū)域,尋找對于BACE1基因的轉(zhuǎn)錄起著關(guān)鍵作用的順式作用元件和最小啟動子區(qū)域,揭示BACE1基因核心啟動子的結(jié)構(gòu)并研究相應(yīng)的功能。
方法:在前期研究的基礎(chǔ)上繼續(xù)構(gòu)建含有不同區(qū)域的BACE1基因啟動子-熒光素酶報告基因載體。用常規(guī)方法培養(yǎng)人胚腎細(xì)胞HEK293,用Invitrogen公司的轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine2000將構(gòu)建的含有不同區(qū)域的BACE1基因啟動子-熒光素酶報告基因載體
2、轉(zhuǎn)染HEK293并使其在細(xì)胞內(nèi)表達(dá)熒光素酶。用Promega公司的雙熒光素酶檢測試劑測定細(xì)胞裂解液熒光素酶的活性并用內(nèi)參照載體的活性進(jìn)行校準(zhǔn),最終活性比值反映BACE1基因啟動子的活性,然后比較其活性在不同載體之間的差異,確定具有啟動子活性的最小區(qū)域的5'端邊界和3'端邊界。在此基礎(chǔ)上,以p3BU-1149/-400或p3BU-583/-400為模板,通過基因定點突變確定BACE1候選順式作用元件的核心序列,通過構(gòu)建相應(yīng)的反向突變質(zhì)粒來
3、驗證順式作用元件的功能,并研究各順式作用元件間的相互作用。
結(jié)果:成功構(gòu)建一系列含有不同區(qū)域的BACE1基因啟動子-熒光素酶報告基因載體,最長的插入片段為874bp,包含BACE1的翻譯起始位點上游1273到400的序列,即B1U-1273/-400,繼續(xù)刪切并轉(zhuǎn)染,5'刪切分析發(fā)現(xiàn)-583/-574和-560/-540這兩個區(qū)域有可能含有啟動子功能發(fā)揮所需的元件。3'刪切分析發(fā)現(xiàn)-480可能是BACE1啟動子活性所必需的。-
4、510/-480對于BACE1的啟動子活性起著關(guān)鍵作用。-550/-480可能是BACE1基因的啟動子核心區(qū)域。通過基因定點突變發(fā)現(xiàn)578G/A,510A/C附近各存在一個功能性的順式作用元件區(qū)域而且各順式作用元件在影響B(tài)ACE1啟動子活性方面具有協(xié)同作用,將這兩個順式作用元件序列分別命名為TCE1,TCE2,TCE1是一個高度保守的近端激活因子,TCE1與核心啟動子之間間隔的堿基個數(shù)而不是堿基的種類對基因的轉(zhuǎn)錄有重要作用,TCE2與B
5、ACE1的基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄密切相關(guān)。通過查詢數(shù)據(jù)庫及5'RACE的結(jié)果發(fā)現(xiàn)BACE1的核心啟動子區(qū)域不含有任何已知的經(jīng)典核心啟動子元件。
結(jié)論:通過實驗已經(jīng)成功找到了BACE1基因啟動子的核心區(qū)域,而且確定了兩個控制BACE1轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵元件TCE1,TCE2,這兩個元件可以相互作用,其中TCE1是一個高度保守的近端激活因子,TCE2與BACE1的基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄密切相關(guān)。最終發(fā)現(xiàn)BACE1的核心啟動子區(qū)域不含有任何已知的經(jīng)典核心啟動子元件,這
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