枳葉片抑制差減雜交cDNA文庫構建及PtrBAM1基因抗寒功能鑒定.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、低溫凍害嚴重制約著一些商業(yè)類柑橘果樹的種植和產量,而通過傳統(tǒng)的育種方法難以獲得耐低溫凍害的柑橘品種。遺傳改良可以彌補傳統(tǒng)育種之不足,但前提是獲得較好的低溫抗性基因。枳(Poncirus trifoliata(L.) Raf)屬于蕓香科枳屬,為柑橘種植時常用的砧木。完全低溫馴化后,枳可耐-26℃低溫,但是其耐寒分子和生理機制的研究還不是很明晰。本研究利用4℃和25℃處理的枳葉片為材料,通過SSH技術篩選了一批低溫應答相關基因。在此基礎上,

2、對篩選的β-淀粉酶基因PtrBAM1及枳中β-淀粉酶其它家族成員進行全長克隆,分析它們在不同脅迫及處理下的表達模式,并重點對PtrBAM1的抗寒功能進行了鑒定。主要結果如下:
   1.用4℃和25℃處理3個月大的實生枳,取不同時間點(6 h,1d,3d,5d,7 d)的葉片提取RNA,將兩個溫度不同時間點的RNA分別混樣分離mRNA,構建低溫SSH正向和反向文庫。兩個文庫差減效率較高,經反Northern blotting驗證

3、,挑選差異表達兩倍以上的基因進行測序和分析。正反向庫中各有188和180條序列成功測序,經CAP3拼接后正向庫獲得106條序列(75個單序列和31個contigs),反向庫中獲得121條序列(98個單序列和23個contigs)。利用Blast2Go對篩選基因的分子功能、生物學過程和細胞元件組分三方面進行注釋分析。按分子功能分,正反庫都可分為7大類,最大兩類為催化和結合蛋白(正反庫中催化蛋白各占43%和39%,結合蛋白各占35%和36%

4、);按生物學過程分,最大兩類為代謝和外界刺激相關(代謝相關正反庫中各占43%和45%,外界刺激各占9%和13%);按細胞元件組分看,低溫下生物膜結構和蛋白質復合體結構相關基因的表達都發(fā)生了改變。
   根據細胞膜保護、過量ROS清除、滲透平衡協(xié)調三個方面,從正反庫中各挑選了6個ESTs進行半定量PCR驗證,進一步驗證它們確實為低溫響應相關基因。另外,低溫下枳葉片中總β-淀粉酶和GST的活性測定結果表明,它們活性的變化都與表達水平

5、相符。
   2.在SSH文庫篩選出(一)β-淀粉酶基因(BAM)片段的基礎上,利用RACE克隆了其全長,命名為PtrBAM1,利用同源序列法依次獲得該家族其它7個基因的全長,命名為PtrBAM2-8。通過序列比對和基因結構可將PtrBAMs分為4大類,Ⅰ類包括PtrBAM5;Ⅱ類包括PtrBAM1-3和PtrBAM8;Ⅲ類包括PtrBAM4;Ⅳ類包括PtrBAM6、7。根據序列比對和前人的研究,推測PtrBAM1可能在枳葉片淀

6、粉降解中起決定性的作用,而PtrBAM6和PtrBAM7可能具有轉錄因子的特性。在低溫、脫水、NaCl、麥芽糖等不同處理下,PtrBAM1-8之間的表達不盡相同,說明該基因家族個成員所行使的生理功能可能也會不同。
   3.淀粉染色實驗和透射電鏡觀察結果顯示PtrBAM1超表達煙草的三個轉基因株系(F6、F11、F25)淀粉積累明顯少于Nud野生型和1301空載系,而RNAi檸檬的兩個系(bam1 L1和L2)淀粉積累明顯多于對

7、照;同時,在正常情況下超表達煙草中β-淀粉酶活性、麥芽糖和可溶性糖含量都高于對照,說明PtrBAM1確實有水解淀粉的生理活性。-4℃凍害1h后常溫恢復3d,超表達株系都可以恢復正常生長,而Nud和1301系絕大部分植株都枯萎死亡。在2℃低溫處理下,超表達系的EL和MDA含量、O2-和H2O2積累都顯著性低于對照。因為整個低溫處理過程中超表達系的β-淀粉酶活性、麥芽糖和可溶性糖含量都高于對照(5d除外),說明PtrBAM1超表達可能通過增

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